Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN4

Rhobtb3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhobtb3Q9CTN4 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rhobtb3Q9CTN4 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rhobtb3Q9CTN4 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rhobtb3Q9CTN4 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rhobtb3Q9CTN4 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rhobtb3Q9CTN4 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rhobtb3Q9CTN4 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rhobtb3Q9CTN4 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rhobtb3Q9CTN4 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rhobtb3Q9CTN4 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rhobtb3Q9CTN4 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rhobtb3Q9CTN4 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rhobtb3Q9CTN4 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rhobtb3Q9CTN4 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rhobtb3Q9CTN4 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rhobtb3Q9CTN4 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rhobtb3Q9CTN4 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rhobtb3Q9CTN4 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rhobtb3Q9CTN4 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rhobtb3Q9CTN4 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rhobtb3Q9CTN4 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rhobtb3Q9CTN4 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rhobtb3Q9CTN4 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rhobtb3Q9CTN4 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rhobtb3Q9CTN4 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rhobtb3Q9CTN4 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rhobtb3Q9CTN4 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rhobtb3Q9CTN4 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rhobtb3Q9CTN4 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Rhobtb3Q9CTN4 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rhobtb3Q9CTN4 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rhobtb3Q9CTN4 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rhobtb3Q9CTN4 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rhobtb3Q9CTN4 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rhobtb3Q9CTN4 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rhobtb3Q9CTN4 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rhobtb3Q9CTN4 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rhobtb3Q9CTN4 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rhobtb3Q9CTN4 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rhobtb3Q9CTN4 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rhobtb3Q9CTN4 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rhobtb3Q9CTN4 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rhobtb3Q9CTN4 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rhobtb3Q9CTN4 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rhobtb3Q9CTN4 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rhobtb3Q9CTN4 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rhobtb3Q9CTN4 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rhobtb3Q9CTN4 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rhobtb3Q9CTN4 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rhobtb3Q9CTN4 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rhobtb3Q9CTN4 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rhobtb3Q9CTN4 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rhobtb3Q9CTN4 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rhobtb3Q9CTN4 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rhobtb3Q9CTN4 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rhobtb3Q9CTN4 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rhobtb3Q9CTN4 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rhobtb3Q9CTN4 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rhobtb3Q9CTN4 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rhobtb3Q9CTN4 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rhobtb3Q9CTN4 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rhobtb3Q9CTN4 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rhobtb3Q9CTN4 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rhobtb3Q9CTN4 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rhobtb3Q9CTN4 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rhobtb3Q9CTN4 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rhobtb3Q9CTN4 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rhobtb3Q9CTN4 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rhobtb3Q9CTN4 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rhobtb3Q9CTN4 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rhobtb3Q9CTN4 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rhobtb3Q9CTN4 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rhobtb3Q9CTN4 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rhobtb3Q9CTN4 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rhobtb3Q9CTN4 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rhobtb3Q9CTN4 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rhobtb3Q9CTN4 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rhobtb3Q9CTN4 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rhobtb3Q9CTN4 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rhobtb3Q9CTN4 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rhobtb3Q9CTN4 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rhobtb3Q9CTN4 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rhobtb3Q9CTN4 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rhobtb3Q9CTN4 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rhobtb3Q9CTN4 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rhobtb3Q9CTN4 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rhobtb3Q9CTN4 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rhobtb3Q9CTN4 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rhobtb3Q9CTN4 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rhobtb3Q9CTN4 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rhobtb3Q9CTN4 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rhobtb3Q9CTN4 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rhobtb3Q9CTN4 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rhobtb3Q9CTN4 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rhobtb3Q9CTN4 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rhobtb3Q9CTN4 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rhobtb3Q9CTN4 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rhobtb3Q9CTN4 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rhobtb3Q9CTN4 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rhobtb3Q9CTN4 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms