Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTH6

Fcf1, rRNA-processing protein FCF1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcf1Q9CTH6 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fcf1Q9CTH6 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fcf1Q9CTH6 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fcf1Q9CTH6 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fcf1Q9CTH6 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fcf1Q9CTH6 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fcf1Q9CTH6 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fcf1Q9CTH6 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fcf1Q9CTH6 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Fcf1Q9CTH6 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fcf1Q9CTH6 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fcf1Q9CTH6 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fcf1Q9CTH6 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Fcf1Q9CTH6 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fcf1Q9CTH6 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Fcf1Q9CTH6 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fcf1Q9CTH6 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fcf1Q9CTH6 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fcf1Q9CTH6 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fcf1Q9CTH6 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Fcf1Q9CTH6 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fcf1Q9CTH6 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fcf1Q9CTH6 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Fcf1Q9CTH6 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fcf1Q9CTH6 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fcf1Q9CTH6 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fcf1Q9CTH6 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fcf1Q9CTH6 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fcf1Q9CTH6 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fcf1Q9CTH6 Gm37744-201ENSMUST00000194616 1590 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Fcf1Q9CTH6 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fcf1Q9CTH6 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fcf1Q9CTH6 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fcf1Q9CTH6 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fcf1Q9CTH6 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fcf1Q9CTH6 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fcf1Q9CTH6 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fcf1Q9CTH6 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fcf1Q9CTH6 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fcf1Q9CTH6 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fcf1Q9CTH6 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fcf1Q9CTH6 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fcf1Q9CTH6 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fcf1Q9CTH6 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Fcf1Q9CTH6 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fcf1Q9CTH6 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fcf1Q9CTH6 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fcf1Q9CTH6 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fcf1Q9CTH6 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fcf1Q9CTH6 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fcf1Q9CTH6 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fcf1Q9CTH6 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fcf1Q9CTH6 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fcf1Q9CTH6 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fcf1Q9CTH6 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fcf1Q9CTH6 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fcf1Q9CTH6 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fcf1Q9CTH6 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fcf1Q9CTH6 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fcf1Q9CTH6 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fcf1Q9CTH6 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Fcf1Q9CTH6 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Fcf1Q9CTH6 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fcf1Q9CTH6 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fcf1Q9CTH6 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fcf1Q9CTH6 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fcf1Q9CTH6 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fcf1Q9CTH6 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fcf1Q9CTH6 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fcf1Q9CTH6 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Fcf1Q9CTH6 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fcf1Q9CTH6 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fcf1Q9CTH6 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Fcf1Q9CTH6 Gm31048-201ENSMUST00000196103 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fcf1Q9CTH6 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fcf1Q9CTH6 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fcf1Q9CTH6 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fcf1Q9CTH6 Thoc7-209ENSMUST00000225325 765 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Fcf1Q9CTH6 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fcf1Q9CTH6 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fcf1Q9CTH6 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fcf1Q9CTH6 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fcf1Q9CTH6 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fcf1Q9CTH6 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Fcf1Q9CTH6 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fcf1Q9CTH6 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fcf1Q9CTH6 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fcf1Q9CTH6 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fcf1Q9CTH6 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fcf1Q9CTH6 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fcf1Q9CTH6 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fcf1Q9CTH6 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fcf1Q9CTH6 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fcf1Q9CTH6 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fcf1Q9CTH6 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fcf1Q9CTH6 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fcf1Q9CTH6 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fcf1Q9CTH6 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fcf1Q9CTH6 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fcf1Q9CTH6 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms