Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSB4

Pard3b, Partitioning defective 3 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 1,203 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard3bQ9CSB4 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pard3bQ9CSB4 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pard3bQ9CSB4 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pard3bQ9CSB4 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pard3bQ9CSB4 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pard3bQ9CSB4 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Pard3bQ9CSB4 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pard3bQ9CSB4 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pard3bQ9CSB4 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pard3bQ9CSB4 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pard3bQ9CSB4 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pard3bQ9CSB4 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Pard3bQ9CSB4 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pard3bQ9CSB4 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pard3bQ9CSB4 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pard3bQ9CSB4 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pard3bQ9CSB4 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pard3bQ9CSB4 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pard3bQ9CSB4 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pard3bQ9CSB4 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pard3bQ9CSB4 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pard3bQ9CSB4 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pard3bQ9CSB4 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pard3bQ9CSB4 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pard3bQ9CSB4 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pard3bQ9CSB4 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pard3bQ9CSB4 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pard3bQ9CSB4 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pard3bQ9CSB4 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pard3bQ9CSB4 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pard3bQ9CSB4 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pard3bQ9CSB4 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pard3bQ9CSB4 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pard3bQ9CSB4 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pard3bQ9CSB4 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pard3bQ9CSB4 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pard3bQ9CSB4 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pard3bQ9CSB4 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pard3bQ9CSB4 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pard3bQ9CSB4 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pard3bQ9CSB4 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pard3bQ9CSB4 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pard3bQ9CSB4 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pard3bQ9CSB4 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pard3bQ9CSB4 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pard3bQ9CSB4 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Pard3bQ9CSB4 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pard3bQ9CSB4 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Pard3bQ9CSB4 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pard3bQ9CSB4 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pard3bQ9CSB4 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pard3bQ9CSB4 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pard3bQ9CSB4 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pard3bQ9CSB4 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pard3bQ9CSB4 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pard3bQ9CSB4 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pard3bQ9CSB4 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pard3bQ9CSB4 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pard3bQ9CSB4 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pard3bQ9CSB4 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pard3bQ9CSB4 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pard3bQ9CSB4 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pard3bQ9CSB4 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pard3bQ9CSB4 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pard3bQ9CSB4 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pard3bQ9CSB4 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pard3bQ9CSB4 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pard3bQ9CSB4 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pard3bQ9CSB4 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pard3bQ9CSB4 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pard3bQ9CSB4 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pard3bQ9CSB4 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pard3bQ9CSB4 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pard3bQ9CSB4 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pard3bQ9CSB4 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pard3bQ9CSB4 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Pard3bQ9CSB4 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Pard3bQ9CSB4 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pard3bQ9CSB4 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Pard3bQ9CSB4 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pard3bQ9CSB4 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Pard3bQ9CSB4 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pard3bQ9CSB4 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pard3bQ9CSB4 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pard3bQ9CSB4 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pard3bQ9CSB4 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pard3bQ9CSB4 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pard3bQ9CSB4 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pard3bQ9CSB4 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pard3bQ9CSB4 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pard3bQ9CSB4 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pard3bQ9CSB4 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pard3bQ9CSB4 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pard3bQ9CSB4 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pard3bQ9CSB4 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pard3bQ9CSB4 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pard3bQ9CSB4 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pard3bQ9CSB4 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pard3bQ9CSB4 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pard3bQ9CSB4 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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