Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRC3

UPF0235 protein C15orf40 homolog, mousemouse

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CRC3 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q9CRC3 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q9CRC3 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q9CRC3 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q9CRC3 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q9CRC3 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q9CRC3 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q9CRC3 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q9CRC3 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q9CRC3 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q9CRC3 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q9CRC3 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q9CRC3 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q9CRC3 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q9CRC3 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q9CRC3 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q9CRC3 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q9CRC3 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Q9CRC3 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q9CRC3 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q9CRC3 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q9CRC3 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q9CRC3 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q9CRC3 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q9CRC3 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Q9CRC3 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q9CRC3 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Q9CRC3 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q9CRC3 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q9CRC3 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q9CRC3 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q9CRC3 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q9CRC3 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q9CRC3 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q9CRC3 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q9CRC3 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q9CRC3 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q9CRC3 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q9CRC3 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q9CRC3 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q9CRC3 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q9CRC3 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q9CRC3 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q9CRC3 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q9CRC3 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q9CRC3 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q9CRC3 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q9CRC3 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q9CRC3 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q9CRC3 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q9CRC3 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Q9CRC3 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q9CRC3 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q9CRC3 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q9CRC3 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q9CRC3 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q9CRC3 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q9CRC3 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q9CRC3 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q9CRC3 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q9CRC3 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q9CRC3 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q9CRC3 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Q9CRC3 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q9CRC3 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q9CRC3 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Q9CRC3 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q9CRC3 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q9CRC3 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q9CRC3 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q9CRC3 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q9CRC3 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q9CRC3 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q9CRC3 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q9CRC3 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q9CRC3 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q9CRC3 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q9CRC3 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q9CRC3 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q9CRC3 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q9CRC3 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q9CRC3 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Q9CRC3 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q9CRC3 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q9CRC3 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q9CRC3 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q9CRC3 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q9CRC3 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q9CRC3 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q9CRC3 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q9CRC3 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q9CRC3 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q9CRC3 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Q9CRC3 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q9CRC3 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Q9CRC3 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Q9CRC3 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q9CRC3 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q9CRC3 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q9CRC3 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
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