Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ90

Uncharacterized protein C9orf85 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQ90 Clec12b-202ENSMUST00000112082 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9CQ90 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9CQ90 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9CQ90 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9CQ90 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9CQ90 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9CQ90 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9CQ90 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9CQ90 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9CQ90 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9CQ90 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9CQ90 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9CQ90 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9CQ90 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9CQ90 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9CQ90 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9CQ90 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Q9CQ90 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9CQ90 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9CQ90 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9CQ90 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9CQ90 AC122539.3-201ENSMUST00000218355 1431 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Q9CQ90 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9CQ90 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9CQ90 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Q9CQ90 Gm11510-201ENSMUST00000120278 347 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Q9CQ90 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Q9CQ90 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Q9CQ90 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9CQ90 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Q9CQ90 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9CQ90 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9CQ90 Gm18352-201ENSMUST00000189113 902 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Q9CQ90 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Q9CQ90 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Q9CQ90 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Q9CQ90 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9CQ90 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9CQ90 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9CQ90 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Q9CQ90 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9CQ90 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9CQ90 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9CQ90 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9CQ90 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Q9CQ90 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9CQ90 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Q9CQ90 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9CQ90 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9CQ90 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9CQ90 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Q9CQ90 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9CQ90 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9CQ90 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9CQ90 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9CQ90 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9CQ90 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9CQ90 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9CQ90 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9CQ90 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9CQ90 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9CQ90 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9CQ90 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9CQ90 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9CQ90 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9CQ90 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9CQ90 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9CQ90 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9CQ90 Gm37866-201ENSMUST00000191950 696 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9CQ90 Gm37024-201ENSMUST00000192224 868 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9CQ90 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9CQ90 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9CQ90 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9CQ90 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9CQ90 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9CQ90 AC173482.2-201ENSMUST00000224044 750 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9CQ90 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9CQ90 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9CQ90 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9CQ90 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9CQ90 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9CQ90 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9CQ90 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9CQ90 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9CQ90 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9CQ90 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9CQ90 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9CQ90 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9CQ90 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9CQ90 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9CQ90 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9CQ90 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9CQ90 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9CQ90 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9CQ90 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9CQ90 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q9CQ90 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q9CQ90 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q9CQ90 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q9CQ90 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms