Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ77

1700129C05Rik, 1700129C05Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700129C05RikQ9CQ77 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
1700129C05RikQ9CQ77 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
1700129C05RikQ9CQ77 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
1700129C05RikQ9CQ77 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
1700129C05RikQ9CQ77 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
1700129C05RikQ9CQ77 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
1700129C05RikQ9CQ77 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
1700129C05RikQ9CQ77 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
1700129C05RikQ9CQ77 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
1700129C05RikQ9CQ77 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
1700129C05RikQ9CQ77 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
1700129C05RikQ9CQ77 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
1700129C05RikQ9CQ77 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
1700129C05RikQ9CQ77 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
1700129C05RikQ9CQ77 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
1700129C05RikQ9CQ77 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
1700129C05RikQ9CQ77 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
1700129C05RikQ9CQ77 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
1700129C05RikQ9CQ77 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
1700129C05RikQ9CQ77 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
1700129C05RikQ9CQ77 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
1700129C05RikQ9CQ77 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
1700129C05RikQ9CQ77 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
1700129C05RikQ9CQ77 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
1700129C05RikQ9CQ77 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
1700129C05RikQ9CQ77 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
1700129C05RikQ9CQ77 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
1700129C05RikQ9CQ77 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
1700129C05RikQ9CQ77 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
1700129C05RikQ9CQ77 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
1700129C05RikQ9CQ77 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
1700129C05RikQ9CQ77 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
1700129C05RikQ9CQ77 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
1700129C05RikQ9CQ77 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
1700129C05RikQ9CQ77 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
1700129C05RikQ9CQ77 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
1700129C05RikQ9CQ77 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
1700129C05RikQ9CQ77 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
1700129C05RikQ9CQ77 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
1700129C05RikQ9CQ77 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
1700129C05RikQ9CQ77 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
1700129C05RikQ9CQ77 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
1700129C05RikQ9CQ77 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
1700129C05RikQ9CQ77 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
1700129C05RikQ9CQ77 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
1700129C05RikQ9CQ77 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
1700129C05RikQ9CQ77 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
1700129C05RikQ9CQ77 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
1700129C05RikQ9CQ77 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
1700129C05RikQ9CQ77 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
1700129C05RikQ9CQ77 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
1700129C05RikQ9CQ77 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
1700129C05RikQ9CQ77 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
1700129C05RikQ9CQ77 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
1700129C05RikQ9CQ77 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
1700129C05RikQ9CQ77 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
1700129C05RikQ9CQ77 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
1700129C05RikQ9CQ77 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
1700129C05RikQ9CQ77 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
1700129C05RikQ9CQ77 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
1700129C05RikQ9CQ77 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
1700129C05RikQ9CQ77 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
1700129C05RikQ9CQ77 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
1700129C05RikQ9CQ77 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
1700129C05RikQ9CQ77 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
1700129C05RikQ9CQ77 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
1700129C05RikQ9CQ77 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
1700129C05RikQ9CQ77 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
1700129C05RikQ9CQ77 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
1700129C05RikQ9CQ77 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
1700129C05RikQ9CQ77 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
1700129C05RikQ9CQ77 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
1700129C05RikQ9CQ77 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
1700129C05RikQ9CQ77 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
1700129C05RikQ9CQ77 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
1700129C05RikQ9CQ77 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
1700129C05RikQ9CQ77 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
1700129C05RikQ9CQ77 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
1700129C05RikQ9CQ77 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
1700129C05RikQ9CQ77 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
1700129C05RikQ9CQ77 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
1700129C05RikQ9CQ77 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
1700129C05RikQ9CQ77 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
1700129C05RikQ9CQ77 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
1700129C05RikQ9CQ77 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
1700129C05RikQ9CQ77 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
1700129C05RikQ9CQ77 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
1700129C05RikQ9CQ77 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
1700129C05RikQ9CQ77 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
1700129C05RikQ9CQ77 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
1700129C05RikQ9CQ77 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
1700129C05RikQ9CQ77 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
1700129C05RikQ9CQ77 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
1700129C05RikQ9CQ77 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
1700129C05RikQ9CQ77 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
1700129C05RikQ9CQ77 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
1700129C05RikQ9CQ77 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
1700129C05RikQ9CQ77 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
1700129C05RikQ9CQ77 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
1700129C05RikQ9CQ77 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms