Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ71

Rpa3, Replication protein A 14 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpa3Q9CQ71 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpa3Q9CQ71 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpa3Q9CQ71 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpa3Q9CQ71 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpa3Q9CQ71 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpa3Q9CQ71 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpa3Q9CQ71 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpa3Q9CQ71 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpa3Q9CQ71 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpa3Q9CQ71 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpa3Q9CQ71 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpa3Q9CQ71 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpa3Q9CQ71 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpa3Q9CQ71 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpa3Q9CQ71 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpa3Q9CQ71 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpa3Q9CQ71 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpa3Q9CQ71 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpa3Q9CQ71 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpa3Q9CQ71 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpa3Q9CQ71 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpa3Q9CQ71 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpa3Q9CQ71 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpa3Q9CQ71 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpa3Q9CQ71 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpa3Q9CQ71 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpa3Q9CQ71 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpa3Q9CQ71 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpa3Q9CQ71 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpa3Q9CQ71 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpa3Q9CQ71 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpa3Q9CQ71 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpa3Q9CQ71 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpa3Q9CQ71 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpa3Q9CQ71 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpa3Q9CQ71 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpa3Q9CQ71 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpa3Q9CQ71 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpa3Q9CQ71 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpa3Q9CQ71 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpa3Q9CQ71 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpa3Q9CQ71 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpa3Q9CQ71 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpa3Q9CQ71 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpa3Q9CQ71 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpa3Q9CQ71 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpa3Q9CQ71 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpa3Q9CQ71 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpa3Q9CQ71 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpa3Q9CQ71 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpa3Q9CQ71 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpa3Q9CQ71 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpa3Q9CQ71 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpa3Q9CQ71 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpa3Q9CQ71 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpa3Q9CQ71 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpa3Q9CQ71 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpa3Q9CQ71 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpa3Q9CQ71 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpa3Q9CQ71 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpa3Q9CQ71 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpa3Q9CQ71 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpa3Q9CQ71 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpa3Q9CQ71 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpa3Q9CQ71 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpa3Q9CQ71 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpa3Q9CQ71 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpa3Q9CQ71 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpa3Q9CQ71 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpa3Q9CQ71 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpa3Q9CQ71 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpa3Q9CQ71 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpa3Q9CQ71 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpa3Q9CQ71 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpa3Q9CQ71 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpa3Q9CQ71 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpa3Q9CQ71 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpa3Q9CQ71 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpa3Q9CQ71 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpa3Q9CQ71 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpa3Q9CQ71 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpa3Q9CQ71 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpa3Q9CQ71 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpa3Q9CQ71 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpa3Q9CQ71 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpa3Q9CQ71 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpa3Q9CQ71 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpa3Q9CQ71 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpa3Q9CQ71 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpa3Q9CQ71 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpa3Q9CQ71 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpa3Q9CQ71 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpa3Q9CQ71 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpa3Q9CQ71 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpa3Q9CQ71 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpa3Q9CQ71 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpa3Q9CQ71 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpa3Q9CQ71 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpa3Q9CQ71 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpa3Q9CQ71 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms