Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ68

1700029P11Rik, RIKEN cDNA 1700029P11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700029P11RikQ9CQ68 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
1700029P11RikQ9CQ68 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
1700029P11RikQ9CQ68 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
1700029P11RikQ9CQ68 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
1700029P11RikQ9CQ68 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
1700029P11RikQ9CQ68 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
1700029P11RikQ9CQ68 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
1700029P11RikQ9CQ68 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
1700029P11RikQ9CQ68 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms