Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ18

Rnaseh2c, Ribonuclease H2 subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnaseh2cQ9CQ18 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Rnaseh2cQ9CQ18 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Rnaseh2cQ9CQ18 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Rnaseh2cQ9CQ18 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Rnaseh2cQ9CQ18 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Rnaseh2cQ9CQ18 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Rnaseh2cQ9CQ18 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Rnaseh2cQ9CQ18 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Rnaseh2cQ9CQ18 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Rnaseh2cQ9CQ18 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Rnaseh2cQ9CQ18 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Rnaseh2cQ9CQ18 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Rnaseh2cQ9CQ18 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rnaseh2cQ9CQ18 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rnaseh2cQ9CQ18 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rnaseh2cQ9CQ18 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rnaseh2cQ9CQ18 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rnaseh2cQ9CQ18 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rnaseh2cQ9CQ18 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rnaseh2cQ9CQ18 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rnaseh2cQ9CQ18 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rnaseh2cQ9CQ18 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rnaseh2cQ9CQ18 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rnaseh2cQ9CQ18 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rnaseh2cQ9CQ18 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rnaseh2cQ9CQ18 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rnaseh2cQ9CQ18 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rnaseh2cQ9CQ18 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rnaseh2cQ9CQ18 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rnaseh2cQ9CQ18 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rnaseh2cQ9CQ18 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rnaseh2cQ9CQ18 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rnaseh2cQ9CQ18 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rnaseh2cQ9CQ18 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rnaseh2cQ9CQ18 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rnaseh2cQ9CQ18 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rnaseh2cQ9CQ18 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rnaseh2cQ9CQ18 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rnaseh2cQ9CQ18 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rnaseh2cQ9CQ18 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rnaseh2cQ9CQ18 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rnaseh2cQ9CQ18 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rnaseh2cQ9CQ18 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rnaseh2cQ9CQ18 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rnaseh2cQ9CQ18 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Rnaseh2cQ9CQ18 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rnaseh2cQ9CQ18 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rnaseh2cQ9CQ18 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rnaseh2cQ9CQ18 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rnaseh2cQ9CQ18 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rnaseh2cQ9CQ18 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rnaseh2cQ9CQ18 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rnaseh2cQ9CQ18 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms