Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atg3Q9CPX6 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atg3Q9CPX6 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atg3Q9CPX6 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atg3Q9CPX6 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atg3Q9CPX6 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atg3Q9CPX6 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atg3Q9CPX6 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atg3Q9CPX6 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atg3Q9CPX6 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atg3Q9CPX6 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atg3Q9CPX6 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atg3Q9CPX6 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atg3Q9CPX6 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atg3Q9CPX6 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atg3Q9CPX6 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atg3Q9CPX6 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atg3Q9CPX6 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atg3Q9CPX6 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atg3Q9CPX6 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atg3Q9CPX6 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atg3Q9CPX6 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atg3Q9CPX6 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atg3Q9CPX6 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atg3Q9CPX6 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atg3Q9CPX6 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atg3Q9CPX6 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atg3Q9CPX6 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atg3Q9CPX6 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atg3Q9CPX6 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atg3Q9CPX6 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atg3Q9CPX6 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atg3Q9CPX6 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Atg3Q9CPX6 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atg3Q9CPX6 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atg3Q9CPX6 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atg3Q9CPX6 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Atg3Q9CPX6 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atg3Q9CPX6 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atg3Q9CPX6 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atg3Q9CPX6 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Atg3Q9CPX6 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atg3Q9CPX6 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atg3Q9CPX6 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atg3Q9CPX6 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atg3Q9CPX6 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atg3Q9CPX6 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atg3Q9CPX6 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atg3Q9CPX6 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atg3Q9CPX6 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atg3Q9CPX6 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atg3Q9CPX6 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atg3Q9CPX6 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atg3Q9CPX6 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atg3Q9CPX6 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atg3Q9CPX6 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atg3Q9CPX6 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atg3Q9CPX6 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atg3Q9CPX6 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atg3Q9CPX6 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atg3Q9CPX6 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atg3Q9CPX6 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atg3Q9CPX6 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atg3Q9CPX6 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atg3Q9CPX6 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Atg3Q9CPX6 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atg3Q9CPX6 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atg3Q9CPX6 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atg3Q9CPX6 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atg3Q9CPX6 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atg3Q9CPX6 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atg3Q9CPX6 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atg3Q9CPX6 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atg3Q9CPX6 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atg3Q9CPX6 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atg3Q9CPX6 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atg3Q9CPX6 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atg3Q9CPX6 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atg3Q9CPX6 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atg3Q9CPX6 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atg3Q9CPX6 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atg3Q9CPX6 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atg3Q9CPX6 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atg3Q9CPX6 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atg3Q9CPX6 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atg3Q9CPX6 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atg3Q9CPX6 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Atg3Q9CPX6 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atg3Q9CPX6 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atg3Q9CPX6 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atg3Q9CPX6 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Atg3Q9CPX6 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atg3Q9CPX6 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atg3Q9CPX6 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atg3Q9CPX6 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atg3Q9CPX6 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atg3Q9CPX6 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Atg3Q9CPX6 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atg3Q9CPX6 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atg3Q9CPX6 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms