Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPU1

Ssxb1, MCG116417, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb1Q9CPU1 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ssxb1Q9CPU1 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ssxb1Q9CPU1 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ssxb1Q9CPU1 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ssxb1Q9CPU1 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ssxb1Q9CPU1 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Ssxb1Q9CPU1 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ssxb1Q9CPU1 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ssxb1Q9CPU1 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ssxb1Q9CPU1 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Ssxb1Q9CPU1 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ssxb1Q9CPU1 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ssxb1Q9CPU1 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ssxb1Q9CPU1 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Ssxb1Q9CPU1 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ssxb1Q9CPU1 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ssxb1Q9CPU1 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ssxb1Q9CPU1 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ssxb1Q9CPU1 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ssxb1Q9CPU1 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ssxb1Q9CPU1 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ssxb1Q9CPU1 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ssxb1Q9CPU1 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ssxb1Q9CPU1 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ssxb1Q9CPU1 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ssxb1Q9CPU1 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ssxb1Q9CPU1 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ssxb1Q9CPU1 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssxb1Q9CPU1 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssxb1Q9CPU1 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssxb1Q9CPU1 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssxb1Q9CPU1 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssxb1Q9CPU1 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssxb1Q9CPU1 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssxb1Q9CPU1 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssxb1Q9CPU1 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssxb1Q9CPU1 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssxb1Q9CPU1 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Ssxb1Q9CPU1 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssxb1Q9CPU1 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssxb1Q9CPU1 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssxb1Q9CPU1 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssxb1Q9CPU1 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssxb1Q9CPU1 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssxb1Q9CPU1 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssxb1Q9CPU1 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssxb1Q9CPU1 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssxb1Q9CPU1 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssxb1Q9CPU1 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssxb1Q9CPU1 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssxb1Q9CPU1 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssxb1Q9CPU1 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssxb1Q9CPU1 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssxb1Q9CPU1 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssxb1Q9CPU1 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssxb1Q9CPU1 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssxb1Q9CPU1 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssxb1Q9CPU1 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssxb1Q9CPU1 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssxb1Q9CPU1 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssxb1Q9CPU1 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssxb1Q9CPU1 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssxb1Q9CPU1 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssxb1Q9CPU1 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssxb1Q9CPU1 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssxb1Q9CPU1 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssxb1Q9CPU1 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssxb1Q9CPU1 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssxb1Q9CPU1 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssxb1Q9CPU1 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssxb1Q9CPU1 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssxb1Q9CPU1 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssxb1Q9CPU1 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssxb1Q9CPU1 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssxb1Q9CPU1 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssxb1Q9CPU1 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssxb1Q9CPU1 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssxb1Q9CPU1 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssxb1Q9CPU1 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssxb1Q9CPU1 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssxb1Q9CPU1 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssxb1Q9CPU1 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssxb1Q9CPU1 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssxb1Q9CPU1 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssxb1Q9CPU1 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssxb1Q9CPU1 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssxb1Q9CPU1 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssxb1Q9CPU1 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssxb1Q9CPU1 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssxb1Q9CPU1 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssxb1Q9CPU1 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssxb1Q9CPU1 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssxb1Q9CPU1 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssxb1Q9CPU1 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssxb1Q9CPU1 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssxb1Q9CPU1 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssxb1Q9CPU1 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssxb1Q9CPU1 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssxb1Q9CPU1 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms