Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR4

Rpl17, 60S ribosomal protein L17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl17Q9CPR4 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpl17Q9CPR4 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpl17Q9CPR4 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpl17Q9CPR4 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpl17Q9CPR4 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpl17Q9CPR4 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpl17Q9CPR4 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpl17Q9CPR4 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpl17Q9CPR4 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpl17Q9CPR4 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpl17Q9CPR4 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpl17Q9CPR4 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpl17Q9CPR4 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpl17Q9CPR4 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpl17Q9CPR4 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpl17Q9CPR4 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpl17Q9CPR4 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpl17Q9CPR4 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpl17Q9CPR4 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpl17Q9CPR4 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpl17Q9CPR4 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpl17Q9CPR4 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpl17Q9CPR4 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpl17Q9CPR4 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpl17Q9CPR4 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpl17Q9CPR4 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpl17Q9CPR4 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpl17Q9CPR4 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpl17Q9CPR4 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpl17Q9CPR4 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpl17Q9CPR4 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpl17Q9CPR4 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpl17Q9CPR4 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpl17Q9CPR4 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpl17Q9CPR4 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpl17Q9CPR4 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpl17Q9CPR4 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpl17Q9CPR4 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpl17Q9CPR4 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpl17Q9CPR4 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpl17Q9CPR4 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpl17Q9CPR4 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpl17Q9CPR4 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpl17Q9CPR4 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpl17Q9CPR4 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpl17Q9CPR4 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpl17Q9CPR4 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpl17Q9CPR4 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpl17Q9CPR4 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpl17Q9CPR4 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpl17Q9CPR4 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpl17Q9CPR4 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpl17Q9CPR4 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpl17Q9CPR4 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl17Q9CPR4 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl17Q9CPR4 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl17Q9CPR4 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl17Q9CPR4 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl17Q9CPR4 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl17Q9CPR4 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl17Q9CPR4 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl17Q9CPR4 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl17Q9CPR4 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl17Q9CPR4 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl17Q9CPR4 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Rpl17Q9CPR4 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl17Q9CPR4 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl17Q9CPR4 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl17Q9CPR4 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl17Q9CPR4 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl17Q9CPR4 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl17Q9CPR4 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl17Q9CPR4 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl17Q9CPR4 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl17Q9CPR4 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl17Q9CPR4 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl17Q9CPR4 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl17Q9CPR4 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl17Q9CPR4 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl17Q9CPR4 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl17Q9CPR4 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl17Q9CPR4 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl17Q9CPR4 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl17Q9CPR4 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl17Q9CPR4 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl17Q9CPR4 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl17Q9CPR4 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl17Q9CPR4 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl17Q9CPR4 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl17Q9CPR4 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl17Q9CPR4 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl17Q9CPR4 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl17Q9CPR4 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl17Q9CPR4 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl17Q9CPR4 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl17Q9CPR4 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl17Q9CPR4 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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