Protein–RNA interactions for Protein: Q99P91

Gpnmb, Transmembrane glycoprotein NMB, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GpnmbQ99P91 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
GpnmbQ99P91 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
GpnmbQ99P91 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
GpnmbQ99P91 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
GpnmbQ99P91 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
GpnmbQ99P91 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
GpnmbQ99P91 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
GpnmbQ99P91 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
GpnmbQ99P91 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
GpnmbQ99P91 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
GpnmbQ99P91 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
GpnmbQ99P91 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
GpnmbQ99P91 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
GpnmbQ99P91 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
GpnmbQ99P91 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
GpnmbQ99P91 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
GpnmbQ99P91 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
GpnmbQ99P91 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
GpnmbQ99P91 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
GpnmbQ99P91 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
GpnmbQ99P91 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
GpnmbQ99P91 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
GpnmbQ99P91 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
GpnmbQ99P91 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
GpnmbQ99P91 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
GpnmbQ99P91 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
GpnmbQ99P91 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
GpnmbQ99P91 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
GpnmbQ99P91 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
GpnmbQ99P91 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
GpnmbQ99P91 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
GpnmbQ99P91 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
GpnmbQ99P91 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
GpnmbQ99P91 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
GpnmbQ99P91 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
GpnmbQ99P91 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
GpnmbQ99P91 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
GpnmbQ99P91 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
GpnmbQ99P91 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
GpnmbQ99P91 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
GpnmbQ99P91 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
GpnmbQ99P91 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
GpnmbQ99P91 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GpnmbQ99P91 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GpnmbQ99P91 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GpnmbQ99P91 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GpnmbQ99P91 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GpnmbQ99P91 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GpnmbQ99P91 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GpnmbQ99P91 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GpnmbQ99P91 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GpnmbQ99P91 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GpnmbQ99P91 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GpnmbQ99P91 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GpnmbQ99P91 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GpnmbQ99P91 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GpnmbQ99P91 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GpnmbQ99P91 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
GpnmbQ99P91 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GpnmbQ99P91 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GpnmbQ99P91 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GpnmbQ99P91 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GpnmbQ99P91 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GpnmbQ99P91 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GpnmbQ99P91 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GpnmbQ99P91 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GpnmbQ99P91 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GpnmbQ99P91 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GpnmbQ99P91 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GpnmbQ99P91 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GpnmbQ99P91 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GpnmbQ99P91 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GpnmbQ99P91 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GpnmbQ99P91 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GpnmbQ99P91 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GpnmbQ99P91 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GpnmbQ99P91 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GpnmbQ99P91 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GpnmbQ99P91 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GpnmbQ99P91 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GpnmbQ99P91 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
GpnmbQ99P91 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
GpnmbQ99P91 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
GpnmbQ99P91 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
GpnmbQ99P91 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
GpnmbQ99P91 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
GpnmbQ99P91 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
GpnmbQ99P91 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
GpnmbQ99P91 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
GpnmbQ99P91 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
GpnmbQ99P91 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
GpnmbQ99P91 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
GpnmbQ99P91 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
GpnmbQ99P91 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
GpnmbQ99P91 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
GpnmbQ99P91 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
GpnmbQ99P91 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
GpnmbQ99P91 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
GpnmbQ99P91 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
GpnmbQ99P91 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms