Protein–RNA interactions for Protein: Q99P25

Tsnaxip1, Translin-associated factor X-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 704 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsnaxip1Q99P25 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tsnaxip1Q99P25 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tsnaxip1Q99P25 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tsnaxip1Q99P25 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tsnaxip1Q99P25 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tsnaxip1Q99P25 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tsnaxip1Q99P25 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tsnaxip1Q99P25 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tsnaxip1Q99P25 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tsnaxip1Q99P25 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tsnaxip1Q99P25 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tsnaxip1Q99P25 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tsnaxip1Q99P25 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tsnaxip1Q99P25 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tsnaxip1Q99P25 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tsnaxip1Q99P25 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tsnaxip1Q99P25 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tsnaxip1Q99P25 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tsnaxip1Q99P25 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tsnaxip1Q99P25 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tsnaxip1Q99P25 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Tsnaxip1Q99P25 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tsnaxip1Q99P25 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tsnaxip1Q99P25 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tsnaxip1Q99P25 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tsnaxip1Q99P25 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tsnaxip1Q99P25 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tsnaxip1Q99P25 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tsnaxip1Q99P25 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tsnaxip1Q99P25 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tsnaxip1Q99P25 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tsnaxip1Q99P25 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tsnaxip1Q99P25 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Tsnaxip1Q99P25 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Tsnaxip1Q99P25 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tsnaxip1Q99P25 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tsnaxip1Q99P25 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tsnaxip1Q99P25 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tsnaxip1Q99P25 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tsnaxip1Q99P25 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tsnaxip1Q99P25 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tsnaxip1Q99P25 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tsnaxip1Q99P25 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tsnaxip1Q99P25 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tsnaxip1Q99P25 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tsnaxip1Q99P25 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tsnaxip1Q99P25 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tsnaxip1Q99P25 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tsnaxip1Q99P25 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Tsnaxip1Q99P25 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tsnaxip1Q99P25 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tsnaxip1Q99P25 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tsnaxip1Q99P25 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tsnaxip1Q99P25 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Tsnaxip1Q99P25 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Tsnaxip1Q99P25 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Tsnaxip1Q99P25 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Tsnaxip1Q99P25 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Tsnaxip1Q99P25 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Tsnaxip1Q99P25 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Tsnaxip1Q99P25 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Tsnaxip1Q99P25 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tsnaxip1Q99P25 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tsnaxip1Q99P25 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Tsnaxip1Q99P25 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Tsnaxip1Q99P25 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Tsnaxip1Q99P25 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Tsnaxip1Q99P25 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Tsnaxip1Q99P25 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Tsnaxip1Q99P25 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Tsnaxip1Q99P25 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Tsnaxip1Q99P25 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Tsnaxip1Q99P25 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Tsnaxip1Q99P25 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tsnaxip1Q99P25 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tsnaxip1Q99P25 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tsnaxip1Q99P25 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tsnaxip1Q99P25 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Tsnaxip1Q99P25 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Tsnaxip1Q99P25 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tsnaxip1Q99P25 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tsnaxip1Q99P25 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Tsnaxip1Q99P25 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tsnaxip1Q99P25 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tsnaxip1Q99P25 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tsnaxip1Q99P25 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tsnaxip1Q99P25 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tsnaxip1Q99P25 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tsnaxip1Q99P25 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tsnaxip1Q99P25 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tsnaxip1Q99P25 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tsnaxip1Q99P25 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tsnaxip1Q99P25 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tsnaxip1Q99P25 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Tsnaxip1Q99P25 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tsnaxip1Q99P25 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tsnaxip1Q99P25 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tsnaxip1Q99P25 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tsnaxip1Q99P25 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tsnaxip1Q99P25 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms