Protein–RNA interactions for Protein: Q99NI3

Gtf2ird2, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2ird2Q99NI3 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf2ird2Q99NI3 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf2ird2Q99NI3 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf2ird2Q99NI3 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf2ird2Q99NI3 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf2ird2Q99NI3 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf2ird2Q99NI3 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf2ird2Q99NI3 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf2ird2Q99NI3 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf2ird2Q99NI3 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf2ird2Q99NI3 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms