Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF3

Cep41, Centrosomal protein of 41 kDa, mousemouse

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Length 373 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep41Q99NF3 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cep41Q99NF3 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cep41Q99NF3 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cep41Q99NF3 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cep41Q99NF3 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cep41Q99NF3 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cep41Q99NF3 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cep41Q99NF3 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cep41Q99NF3 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cep41Q99NF3 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cep41Q99NF3 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cep41Q99NF3 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cep41Q99NF3 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cep41Q99NF3 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cep41Q99NF3 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cep41Q99NF3 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cep41Q99NF3 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cep41Q99NF3 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cep41Q99NF3 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cep41Q99NF3 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cep41Q99NF3 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cep41Q99NF3 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cep41Q99NF3 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cep41Q99NF3 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cep41Q99NF3 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cep41Q99NF3 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cep41Q99NF3 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cep41Q99NF3 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cep41Q99NF3 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cep41Q99NF3 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cep41Q99NF3 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cep41Q99NF3 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cep41Q99NF3 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cep41Q99NF3 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cep41Q99NF3 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cep41Q99NF3 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cep41Q99NF3 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cep41Q99NF3 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cep41Q99NF3 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cep41Q99NF3 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cep41Q99NF3 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cep41Q99NF3 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cep41Q99NF3 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cep41Q99NF3 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cep41Q99NF3 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cep41Q99NF3 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Cep41Q99NF3 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cep41Q99NF3 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cep41Q99NF3 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cep41Q99NF3 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cep41Q99NF3 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cep41Q99NF3 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cep41Q99NF3 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Cep41Q99NF3 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cep41Q99NF3 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cep41Q99NF3 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cep41Q99NF3 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cep41Q99NF3 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cep41Q99NF3 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Cep41Q99NF3 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cep41Q99NF3 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cep41Q99NF3 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cep41Q99NF3 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cep41Q99NF3 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cep41Q99NF3 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cep41Q99NF3 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cep41Q99NF3 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cep41Q99NF3 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cep41Q99NF3 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cep41Q99NF3 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cep41Q99NF3 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cep41Q99NF3 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cep41Q99NF3 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cep41Q99NF3 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cep41Q99NF3 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cep41Q99NF3 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cep41Q99NF3 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cep41Q99NF3 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cep41Q99NF3 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cep41Q99NF3 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cep41Q99NF3 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cep41Q99NF3 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cep41Q99NF3 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cep41Q99NF3 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cep41Q99NF3 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cep41Q99NF3 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cep41Q99NF3 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Cep41Q99NF3 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cep41Q99NF3 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cep41Q99NF3 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cep41Q99NF3 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cep41Q99NF3 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cep41Q99NF3 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cep41Q99NF3 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cep41Q99NF3 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cep41Q99NF3 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cep41Q99NF3 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cep41Q99NF3 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cep41Q99NF3 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cep41Q99NF3 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms