Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF2

Nsmf, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NsmfQ99NF2 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NsmfQ99NF2 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NsmfQ99NF2 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NsmfQ99NF2 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NsmfQ99NF2 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NsmfQ99NF2 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NsmfQ99NF2 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NsmfQ99NF2 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
NsmfQ99NF2 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
NsmfQ99NF2 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NsmfQ99NF2 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NsmfQ99NF2 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
NsmfQ99NF2 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NsmfQ99NF2 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NsmfQ99NF2 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NsmfQ99NF2 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NsmfQ99NF2 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NsmfQ99NF2 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NsmfQ99NF2 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NsmfQ99NF2 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NsmfQ99NF2 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NsmfQ99NF2 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NsmfQ99NF2 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NsmfQ99NF2 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NsmfQ99NF2 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NsmfQ99NF2 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NsmfQ99NF2 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
NsmfQ99NF2 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
NsmfQ99NF2 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
NsmfQ99NF2 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NsmfQ99NF2 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NsmfQ99NF2 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NsmfQ99NF2 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NsmfQ99NF2 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NsmfQ99NF2 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
NsmfQ99NF2 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
NsmfQ99NF2 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NsmfQ99NF2 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NsmfQ99NF2 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NsmfQ99NF2 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NsmfQ99NF2 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NsmfQ99NF2 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NsmfQ99NF2 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
NsmfQ99NF2 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NsmfQ99NF2 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NsmfQ99NF2 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NsmfQ99NF2 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NsmfQ99NF2 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NsmfQ99NF2 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NsmfQ99NF2 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NsmfQ99NF2 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NsmfQ99NF2 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NsmfQ99NF2 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NsmfQ99NF2 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NsmfQ99NF2 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NsmfQ99NF2 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NsmfQ99NF2 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NsmfQ99NF2 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NsmfQ99NF2 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NsmfQ99NF2 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NsmfQ99NF2 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NsmfQ99NF2 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NsmfQ99NF2 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NsmfQ99NF2 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NsmfQ99NF2 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NsmfQ99NF2 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NsmfQ99NF2 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NsmfQ99NF2 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
NsmfQ99NF2 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NsmfQ99NF2 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NsmfQ99NF2 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
NsmfQ99NF2 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NsmfQ99NF2 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NsmfQ99NF2 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NsmfQ99NF2 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NsmfQ99NF2 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NsmfQ99NF2 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NsmfQ99NF2 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NsmfQ99NF2 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NsmfQ99NF2 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NsmfQ99NF2 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NsmfQ99NF2 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NsmfQ99NF2 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NsmfQ99NF2 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NsmfQ99NF2 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NsmfQ99NF2 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NsmfQ99NF2 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NsmfQ99NF2 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NsmfQ99NF2 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NsmfQ99NF2 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NsmfQ99NF2 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
NsmfQ99NF2 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NsmfQ99NF2 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NsmfQ99NF2 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NsmfQ99NF2 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
NsmfQ99NF2 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
NsmfQ99NF2 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NsmfQ99NF2 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NsmfQ99NF2 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NsmfQ99NF2 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms