Protein–RNA interactions for Protein: Q99NA2

Atoh8, Protein atonal homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atoh8Q99NA2 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atoh8Q99NA2 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atoh8Q99NA2 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atoh8Q99NA2 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atoh8Q99NA2 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atoh8Q99NA2 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atoh8Q99NA2 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atoh8Q99NA2 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atoh8Q99NA2 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atoh8Q99NA2 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atoh8Q99NA2 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atoh8Q99NA2 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atoh8Q99NA2 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atoh8Q99NA2 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atoh8Q99NA2 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atoh8Q99NA2 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atoh8Q99NA2 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atoh8Q99NA2 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atoh8Q99NA2 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atoh8Q99NA2 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atoh8Q99NA2 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Atoh8Q99NA2 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Atoh8Q99NA2 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atoh8Q99NA2 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atoh8Q99NA2 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atoh8Q99NA2 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atoh8Q99NA2 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atoh8Q99NA2 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atoh8Q99NA2 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atoh8Q99NA2 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atoh8Q99NA2 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atoh8Q99NA2 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atoh8Q99NA2 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atoh8Q99NA2 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atoh8Q99NA2 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atoh8Q99NA2 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atoh8Q99NA2 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atoh8Q99NA2 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atoh8Q99NA2 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Atoh8Q99NA2 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atoh8Q99NA2 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Atoh8Q99NA2 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atoh8Q99NA2 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atoh8Q99NA2 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atoh8Q99NA2 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atoh8Q99NA2 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atoh8Q99NA2 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atoh8Q99NA2 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atoh8Q99NA2 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atoh8Q99NA2 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Atoh8Q99NA2 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atoh8Q99NA2 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atoh8Q99NA2 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atoh8Q99NA2 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atoh8Q99NA2 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atoh8Q99NA2 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Atoh8Q99NA2 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atoh8Q99NA2 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Atoh8Q99NA2 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Atoh8Q99NA2 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Atoh8Q99NA2 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atoh8Q99NA2 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atoh8Q99NA2 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atoh8Q99NA2 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atoh8Q99NA2 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atoh8Q99NA2 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atoh8Q99NA2 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atoh8Q99NA2 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atoh8Q99NA2 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atoh8Q99NA2 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atoh8Q99NA2 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atoh8Q99NA2 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atoh8Q99NA2 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atoh8Q99NA2 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Atoh8Q99NA2 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atoh8Q99NA2 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Atoh8Q99NA2 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atoh8Q99NA2 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atoh8Q99NA2 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atoh8Q99NA2 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Atoh8Q99NA2 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atoh8Q99NA2 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atoh8Q99NA2 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Atoh8Q99NA2 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atoh8Q99NA2 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atoh8Q99NA2 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atoh8Q99NA2 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atoh8Q99NA2 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Atoh8Q99NA2 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Atoh8Q99NA2 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atoh8Q99NA2 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Atoh8Q99NA2 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atoh8Q99NA2 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atoh8Q99NA2 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atoh8Q99NA2 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atoh8Q99NA2 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atoh8Q99NA2 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atoh8Q99NA2 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atoh8Q99NA2 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atoh8Q99NA2 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms