Protein–RNA interactions for Protein: Q99N13

Hdac9, Histone deacetylase 9, mousemouse

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac9Q99N13 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hdac9Q99N13 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hdac9Q99N13 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hdac9Q99N13 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hdac9Q99N13 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hdac9Q99N13 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hdac9Q99N13 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
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Hdac9Q99N13 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hdac9Q99N13 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
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Hdac9Q99N13 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hdac9Q99N13 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hdac9Q99N13 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hdac9Q99N13 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hdac9Q99N13 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hdac9Q99N13 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hdac9Q99N13 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hdac9Q99N13 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hdac9Q99N13 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
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Hdac9Q99N13 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hdac9Q99N13 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
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Hdac9Q99N13 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hdac9Q99N13 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
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Hdac9Q99N13 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hdac9Q99N13 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hdac9Q99N13 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hdac9Q99N13 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hdac9Q99N13 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
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Hdac9Q99N13 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hdac9Q99N13 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
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Hdac9Q99N13 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
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Hdac9Q99N13 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hdac9Q99N13 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
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Hdac9Q99N13 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hdac9Q99N13 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
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Hdac9Q99N13 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hdac9Q99N13 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hdac9Q99N13 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hdac9Q99N13 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hdac9Q99N13 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hdac9Q99N13 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
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Hdac9Q99N13 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
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