Protein–RNA interactions for Protein: Q99LH9

Sh3bp5l, SH3 domain-binding protein 5-like, mousemouse

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Length 392 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5lQ99LH9 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sh3bp5lQ99LH9 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sh3bp5lQ99LH9 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sh3bp5lQ99LH9 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sh3bp5lQ99LH9 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sh3bp5lQ99LH9 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sh3bp5lQ99LH9 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
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Sh3bp5lQ99LH9 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Sh3bp5lQ99LH9 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sh3bp5lQ99LH9 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sh3bp5lQ99LH9 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sh3bp5lQ99LH9 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sh3bp5lQ99LH9 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sh3bp5lQ99LH9 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
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Sh3bp5lQ99LH9 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sh3bp5lQ99LH9 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sh3bp5lQ99LH9 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sh3bp5lQ99LH9 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sh3bp5lQ99LH9 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sh3bp5lQ99LH9 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sh3bp5lQ99LH9 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
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Sh3bp5lQ99LH9 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sh3bp5lQ99LH9 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sh3bp5lQ99LH9 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sh3bp5lQ99LH9 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sh3bp5lQ99LH9 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sh3bp5lQ99LH9 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sh3bp5lQ99LH9 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sh3bp5lQ99LH9 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sh3bp5lQ99LH9 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sh3bp5lQ99LH9 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sh3bp5lQ99LH9 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sh3bp5lQ99LH9 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sh3bp5lQ99LH9 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sh3bp5lQ99LH9 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sh3bp5lQ99LH9 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sh3bp5lQ99LH9 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sh3bp5lQ99LH9 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sh3bp5lQ99LH9 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sh3bp5lQ99LH9 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
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Sh3bp5lQ99LH9 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
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Sh3bp5lQ99LH9 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sh3bp5lQ99LH9 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sh3bp5lQ99LH9 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
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Sh3bp5lQ99LH9 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sh3bp5lQ99LH9 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sh3bp5lQ99LH9 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sh3bp5lQ99LH9 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sh3bp5lQ99LH9 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sh3bp5lQ99LH9 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sh3bp5lQ99LH9 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
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Sh3bp5lQ99LH9 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sh3bp5lQ99LH9 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sh3bp5lQ99LH9 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sh3bp5lQ99LH9 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sh3bp5lQ99LH9 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sh3bp5lQ99LH9 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sh3bp5lQ99LH9 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sh3bp5lQ99LH9 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Sh3bp5lQ99LH9 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sh3bp5lQ99LH9 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sh3bp5lQ99LH9 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sh3bp5lQ99LH9 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sh3bp5lQ99LH9 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sh3bp5lQ99LH9 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sh3bp5lQ99LH9 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sh3bp5lQ99LH9 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sh3bp5lQ99LH9 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sh3bp5lQ99LH9 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sh3bp5lQ99LH9 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sh3bp5lQ99LH9 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sh3bp5lQ99LH9 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sh3bp5lQ99LH9 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sh3bp5lQ99LH9 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sh3bp5lQ99LH9 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sh3bp5lQ99LH9 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sh3bp5lQ99LH9 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sh3bp5lQ99LH9 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Sh3bp5lQ99LH9 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sh3bp5lQ99LH9 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sh3bp5lQ99LH9 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sh3bp5lQ99LH9 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sh3bp5lQ99LH9 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sh3bp5lQ99LH9 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
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