Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG2

Tnpo2, Transportin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnpo2Q99LG2 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnpo2Q99LG2 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnpo2Q99LG2 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnpo2Q99LG2 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnpo2Q99LG2 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnpo2Q99LG2 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnpo2Q99LG2 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnpo2Q99LG2 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnpo2Q99LG2 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnpo2Q99LG2 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnpo2Q99LG2 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnpo2Q99LG2 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnpo2Q99LG2 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnpo2Q99LG2 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnpo2Q99LG2 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnpo2Q99LG2 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnpo2Q99LG2 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnpo2Q99LG2 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnpo2Q99LG2 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnpo2Q99LG2 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnpo2Q99LG2 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnpo2Q99LG2 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnpo2Q99LG2 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnpo2Q99LG2 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnpo2Q99LG2 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnpo2Q99LG2 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnpo2Q99LG2 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnpo2Q99LG2 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnpo2Q99LG2 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnpo2Q99LG2 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnpo2Q99LG2 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnpo2Q99LG2 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnpo2Q99LG2 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnpo2Q99LG2 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnpo2Q99LG2 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnpo2Q99LG2 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnpo2Q99LG2 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnpo2Q99LG2 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnpo2Q99LG2 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnpo2Q99LG2 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnpo2Q99LG2 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnpo2Q99LG2 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnpo2Q99LG2 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnpo2Q99LG2 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnpo2Q99LG2 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnpo2Q99LG2 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnpo2Q99LG2 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnpo2Q99LG2 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnpo2Q99LG2 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnpo2Q99LG2 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnpo2Q99LG2 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnpo2Q99LG2 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnpo2Q99LG2 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnpo2Q99LG2 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnpo2Q99LG2 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnpo2Q99LG2 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnpo2Q99LG2 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnpo2Q99LG2 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnpo2Q99LG2 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnpo2Q99LG2 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnpo2Q99LG2 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnpo2Q99LG2 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnpo2Q99LG2 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnpo2Q99LG2 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnpo2Q99LG2 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnpo2Q99LG2 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnpo2Q99LG2 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnpo2Q99LG2 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnpo2Q99LG2 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnpo2Q99LG2 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnpo2Q99LG2 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnpo2Q99LG2 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnpo2Q99LG2 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnpo2Q99LG2 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnpo2Q99LG2 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnpo2Q99LG2 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnpo2Q99LG2 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnpo2Q99LG2 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnpo2Q99LG2 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnpo2Q99LG2 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnpo2Q99LG2 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnpo2Q99LG2 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnpo2Q99LG2 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnpo2Q99LG2 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnpo2Q99LG2 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnpo2Q99LG2 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnpo2Q99LG2 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnpo2Q99LG2 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnpo2Q99LG2 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnpo2Q99LG2 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnpo2Q99LG2 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnpo2Q99LG2 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnpo2Q99LG2 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnpo2Q99LG2 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnpo2Q99LG2 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnpo2Q99LG2 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnpo2Q99LG2 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnpo2Q99LG2 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnpo2Q99LG2 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnpo2Q99LG2 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms