Protein–RNA interactions for Protein: Q99LE6

Abcf2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf2Q99LE6 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Abcf2Q99LE6 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Abcf2Q99LE6 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Abcf2Q99LE6 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Abcf2Q99LE6 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Abcf2Q99LE6 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Abcf2Q99LE6 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Abcf2Q99LE6 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Abcf2Q99LE6 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Abcf2Q99LE6 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Abcf2Q99LE6 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Abcf2Q99LE6 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Abcf2Q99LE6 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Abcf2Q99LE6 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Abcf2Q99LE6 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Abcf2Q99LE6 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Abcf2Q99LE6 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Abcf2Q99LE6 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Abcf2Q99LE6 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Abcf2Q99LE6 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Abcf2Q99LE6 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Abcf2Q99LE6 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Abcf2Q99LE6 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Abcf2Q99LE6 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Abcf2Q99LE6 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Abcf2Q99LE6 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Abcf2Q99LE6 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Abcf2Q99LE6 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Abcf2Q99LE6 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Abcf2Q99LE6 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Abcf2Q99LE6 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Abcf2Q99LE6 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Abcf2Q99LE6 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Abcf2Q99LE6 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Abcf2Q99LE6 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Abcf2Q99LE6 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Abcf2Q99LE6 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Abcf2Q99LE6 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Abcf2Q99LE6 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Abcf2Q99LE6 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Abcf2Q99LE6 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Abcf2Q99LE6 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Abcf2Q99LE6 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Abcf2Q99LE6 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Abcf2Q99LE6 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Abcf2Q99LE6 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Abcf2Q99LE6 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Abcf2Q99LE6 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Abcf2Q99LE6 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Abcf2Q99LE6 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Abcf2Q99LE6 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Abcf2Q99LE6 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Abcf2Q99LE6 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Abcf2Q99LE6 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Abcf2Q99LE6 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Abcf2Q99LE6 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Abcf2Q99LE6 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Abcf2Q99LE6 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Abcf2Q99LE6 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Abcf2Q99LE6 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Abcf2Q99LE6 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Abcf2Q99LE6 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Abcf2Q99LE6 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Abcf2Q99LE6 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Abcf2Q99LE6 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Abcf2Q99LE6 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Abcf2Q99LE6 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Abcf2Q99LE6 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcf2Q99LE6 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcf2Q99LE6 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcf2Q99LE6 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcf2Q99LE6 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcf2Q99LE6 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcf2Q99LE6 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcf2Q99LE6 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcf2Q99LE6 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcf2Q99LE6 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcf2Q99LE6 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcf2Q99LE6 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcf2Q99LE6 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcf2Q99LE6 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcf2Q99LE6 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcf2Q99LE6 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcf2Q99LE6 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcf2Q99LE6 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcf2Q99LE6 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcf2Q99LE6 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcf2Q99LE6 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcf2Q99LE6 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcf2Q99LE6 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcf2Q99LE6 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcf2Q99LE6 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcf2Q99LE6 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcf2Q99LE6 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcf2Q99LE6 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcf2Q99LE6 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcf2Q99LE6 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcf2Q99LE6 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcf2Q99LE6 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcf2Q99LE6 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms