Protein–RNA interactions for Protein: Q99KL7

Rab28, Ras-related protein Rab-28, mousemouse

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Length 221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab28Q99KL7 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rab28Q99KL7 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rab28Q99KL7 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rab28Q99KL7 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rab28Q99KL7 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rab28Q99KL7 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rab28Q99KL7 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rab28Q99KL7 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rab28Q99KL7 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rab28Q99KL7 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rab28Q99KL7 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rab28Q99KL7 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rab28Q99KL7 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rab28Q99KL7 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Rab28Q99KL7 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Rab28Q99KL7 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rab28Q99KL7 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Rab28Q99KL7 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Rab28Q99KL7 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rab28Q99KL7 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rab28Q99KL7 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rab28Q99KL7 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rab28Q99KL7 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rab28Q99KL7 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rab28Q99KL7 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rab28Q99KL7 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rab28Q99KL7 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rab28Q99KL7 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rab28Q99KL7 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Rab28Q99KL7 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab28Q99KL7 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab28Q99KL7 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab28Q99KL7 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab28Q99KL7 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab28Q99KL7 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab28Q99KL7 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab28Q99KL7 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab28Q99KL7 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab28Q99KL7 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab28Q99KL7 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab28Q99KL7 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab28Q99KL7 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab28Q99KL7 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Rab28Q99KL7 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab28Q99KL7 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab28Q99KL7 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Rab28Q99KL7 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab28Q99KL7 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab28Q99KL7 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Rab28Q99KL7 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab28Q99KL7 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Rab28Q99KL7 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab28Q99KL7 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab28Q99KL7 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Rab28Q99KL7 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Rab28Q99KL7 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab28Q99KL7 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab28Q99KL7 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab28Q99KL7 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Rab28Q99KL7 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab28Q99KL7 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab28Q99KL7 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab28Q99KL7 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab28Q99KL7 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab28Q99KL7 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab28Q99KL7 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab28Q99KL7 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab28Q99KL7 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab28Q99KL7 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab28Q99KL7 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab28Q99KL7 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab28Q99KL7 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab28Q99KL7 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab28Q99KL7 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab28Q99KL7 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab28Q99KL7 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab28Q99KL7 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab28Q99KL7 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab28Q99KL7 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab28Q99KL7 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab28Q99KL7 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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