Protein–RNA interactions for Protein: Q99K46

Usp11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp11Q99K46 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp11Q99K46 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp11Q99K46 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp11Q99K46 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp11Q99K46 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp11Q99K46 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp11Q99K46 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp11Q99K46 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp11Q99K46 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp11Q99K46 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp11Q99K46 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp11Q99K46 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp11Q99K46 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp11Q99K46 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp11Q99K46 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp11Q99K46 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp11Q99K46 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp11Q99K46 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp11Q99K46 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp11Q99K46 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp11Q99K46 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp11Q99K46 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp11Q99K46 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp11Q99K46 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp11Q99K46 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp11Q99K46 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp11Q99K46 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp11Q99K46 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp11Q99K46 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp11Q99K46 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp11Q99K46 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp11Q99K46 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp11Q99K46 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp11Q99K46 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp11Q99K46 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp11Q99K46 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp11Q99K46 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp11Q99K46 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp11Q99K46 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp11Q99K46 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp11Q99K46 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp11Q99K46 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp11Q99K46 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp11Q99K46 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp11Q99K46 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp11Q99K46 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp11Q99K46 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp11Q99K46 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp11Q99K46 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp11Q99K46 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp11Q99K46 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp11Q99K46 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp11Q99K46 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp11Q99K46 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp11Q99K46 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp11Q99K46 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp11Q99K46 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp11Q99K46 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp11Q99K46 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp11Q99K46 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp11Q99K46 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp11Q99K46 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp11Q99K46 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp11Q99K46 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp11Q99K46 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp11Q99K46 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp11Q99K46 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp11Q99K46 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp11Q99K46 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp11Q99K46 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp11Q99K46 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp11Q99K46 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp11Q99K46 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp11Q99K46 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp11Q99K46 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp11Q99K46 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp11Q99K46 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp11Q99K46 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp11Q99K46 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp11Q99K46 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp11Q99K46 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp11Q99K46 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp11Q99K46 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp11Q99K46 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp11Q99K46 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp11Q99K46 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp11Q99K46 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp11Q99K46 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp11Q99K46 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp11Q99K46 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp11Q99K46 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp11Q99K46 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp11Q99K46 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp11Q99K46 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp11Q99K46 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp11Q99K46 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp11Q99K46 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp11Q99K46 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp11Q99K46 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp11Q99K46 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.9 ms