Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY4

Trabd, TraB domain-containing protein, mousemouse

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrabdQ99JY4 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TrabdQ99JY4 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TrabdQ99JY4 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TrabdQ99JY4 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TrabdQ99JY4 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TrabdQ99JY4 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TrabdQ99JY4 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TrabdQ99JY4 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TrabdQ99JY4 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TrabdQ99JY4 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TrabdQ99JY4 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TrabdQ99JY4 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TrabdQ99JY4 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TrabdQ99JY4 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TrabdQ99JY4 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TrabdQ99JY4 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TrabdQ99JY4 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TrabdQ99JY4 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TrabdQ99JY4 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TrabdQ99JY4 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TrabdQ99JY4 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TrabdQ99JY4 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TrabdQ99JY4 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TrabdQ99JY4 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TrabdQ99JY4 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TrabdQ99JY4 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TrabdQ99JY4 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TrabdQ99JY4 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TrabdQ99JY4 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TrabdQ99JY4 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TrabdQ99JY4 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TrabdQ99JY4 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TrabdQ99JY4 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TrabdQ99JY4 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TrabdQ99JY4 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TrabdQ99JY4 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TrabdQ99JY4 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TrabdQ99JY4 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TrabdQ99JY4 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TrabdQ99JY4 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TrabdQ99JY4 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TrabdQ99JY4 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TrabdQ99JY4 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TrabdQ99JY4 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TrabdQ99JY4 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TrabdQ99JY4 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TrabdQ99JY4 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TrabdQ99JY4 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TrabdQ99JY4 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TrabdQ99JY4 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TrabdQ99JY4 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TrabdQ99JY4 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TrabdQ99JY4 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TrabdQ99JY4 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TrabdQ99JY4 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TrabdQ99JY4 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TrabdQ99JY4 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TrabdQ99JY4 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TrabdQ99JY4 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TrabdQ99JY4 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TrabdQ99JY4 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TrabdQ99JY4 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TrabdQ99JY4 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TrabdQ99JY4 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TrabdQ99JY4 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TrabdQ99JY4 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TrabdQ99JY4 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TrabdQ99JY4 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TrabdQ99JY4 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TrabdQ99JY4 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TrabdQ99JY4 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TrabdQ99JY4 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TrabdQ99JY4 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TrabdQ99JY4 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TrabdQ99JY4 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TrabdQ99JY4 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TrabdQ99JY4 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TrabdQ99JY4 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TrabdQ99JY4 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TrabdQ99JY4 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TrabdQ99JY4 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TrabdQ99JY4 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TrabdQ99JY4 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TrabdQ99JY4 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TrabdQ99JY4 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TrabdQ99JY4 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TrabdQ99JY4 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TrabdQ99JY4 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TrabdQ99JY4 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TrabdQ99JY4 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
TrabdQ99JY4 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TrabdQ99JY4 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TrabdQ99JY4 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TrabdQ99JY4 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TrabdQ99JY4 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TrabdQ99JY4 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TrabdQ99JY4 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TrabdQ99JY4 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TrabdQ99JY4 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TrabdQ99JY4 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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