Protein–RNA interactions for Protein: Q99J95

Cdk9, Cyclin-dependent kinase 9, mousemouse

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk9Q99J95 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdk9Q99J95 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdk9Q99J95 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdk9Q99J95 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdk9Q99J95 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdk9Q99J95 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdk9Q99J95 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdk9Q99J95 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdk9Q99J95 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdk9Q99J95 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdk9Q99J95 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdk9Q99J95 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdk9Q99J95 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdk9Q99J95 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdk9Q99J95 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdk9Q99J95 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdk9Q99J95 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdk9Q99J95 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdk9Q99J95 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdk9Q99J95 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdk9Q99J95 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdk9Q99J95 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdk9Q99J95 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdk9Q99J95 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdk9Q99J95 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdk9Q99J95 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdk9Q99J95 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdk9Q99J95 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdk9Q99J95 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdk9Q99J95 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdk9Q99J95 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdk9Q99J95 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdk9Q99J95 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdk9Q99J95 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdk9Q99J95 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdk9Q99J95 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Cdk9Q99J95 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdk9Q99J95 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdk9Q99J95 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Cdk9Q99J95 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdk9Q99J95 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdk9Q99J95 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Cdk9Q99J95 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdk9Q99J95 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Cdk9Q99J95 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdk9Q99J95 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdk9Q99J95 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdk9Q99J95 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdk9Q99J95 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdk9Q99J95 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdk9Q99J95 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdk9Q99J95 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdk9Q99J95 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdk9Q99J95 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdk9Q99J95 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdk9Q99J95 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdk9Q99J95 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdk9Q99J95 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdk9Q99J95 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdk9Q99J95 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdk9Q99J95 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdk9Q99J95 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdk9Q99J95 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdk9Q99J95 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdk9Q99J95 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdk9Q99J95 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdk9Q99J95 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdk9Q99J95 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdk9Q99J95 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdk9Q99J95 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdk9Q99J95 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdk9Q99J95 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdk9Q99J95 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdk9Q99J95 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdk9Q99J95 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdk9Q99J95 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdk9Q99J95 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdk9Q99J95 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdk9Q99J95 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdk9Q99J95 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdk9Q99J95 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdk9Q99J95 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdk9Q99J95 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdk9Q99J95 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdk9Q99J95 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdk9Q99J95 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdk9Q99J95 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdk9Q99J95 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdk9Q99J95 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdk9Q99J95 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdk9Q99J95 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdk9Q99J95 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdk9Q99J95 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdk9Q99J95 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdk9Q99J95 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdk9Q99J95 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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