Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

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Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn16Q925N4 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn16Q925N4 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn16Q925N4 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn16Q925N4 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn16Q925N4 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn16Q925N4 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn16Q925N4 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn16Q925N4 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn16Q925N4 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn16Q925N4 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn16Q925N4 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn16Q925N4 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn16Q925N4 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn16Q925N4 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn16Q925N4 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn16Q925N4 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn16Q925N4 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn16Q925N4 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn16Q925N4 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn16Q925N4 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn16Q925N4 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn16Q925N4 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn16Q925N4 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn16Q925N4 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn16Q925N4 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn16Q925N4 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn16Q925N4 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn16Q925N4 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn16Q925N4 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn16Q925N4 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn16Q925N4 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn16Q925N4 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn16Q925N4 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn16Q925N4 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn16Q925N4 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn16Q925N4 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn16Q925N4 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn16Q925N4 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn16Q925N4 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn16Q925N4 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn16Q925N4 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn16Q925N4 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn16Q925N4 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn16Q925N4 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn16Q925N4 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn16Q925N4 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn16Q925N4 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn16Q925N4 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn16Q925N4 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn16Q925N4 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn16Q925N4 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn16Q925N4 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn16Q925N4 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn16Q925N4 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn16Q925N4 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn16Q925N4 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn16Q925N4 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn16Q925N4 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn16Q925N4 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn16Q925N4 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn16Q925N4 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn16Q925N4 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn16Q925N4 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn16Q925N4 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn16Q925N4 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Cldn16Q925N4 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn16Q925N4 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn16Q925N4 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn16Q925N4 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn16Q925N4 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn16Q925N4 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn16Q925N4 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn16Q925N4 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn16Q925N4 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn16Q925N4 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn16Q925N4 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn16Q925N4 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn16Q925N4 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn16Q925N4 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn16Q925N4 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn16Q925N4 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn16Q925N4 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn16Q925N4 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn16Q925N4 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn16Q925N4 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn16Q925N4 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn16Q925N4 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn16Q925N4 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn16Q925N4 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn16Q925N4 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn16Q925N4 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn16Q925N4 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn16Q925N4 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn16Q925N4 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn16Q925N4 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn16Q925N4 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn16Q925N4 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn16Q925N4 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
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