Protein–RNA interactions for Protein: Q922J3

Clip1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip1Q922J3 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Clip1Q922J3 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Clip1Q922J3 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Clip1Q922J3 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Clip1Q922J3 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Clip1Q922J3 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Clip1Q922J3 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Clip1Q922J3 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Clip1Q922J3 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Clip1Q922J3 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Clip1Q922J3 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Clip1Q922J3 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Clip1Q922J3 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Clip1Q922J3 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Clip1Q922J3 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Clip1Q922J3 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Clip1Q922J3 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Clip1Q922J3 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Clip1Q922J3 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Clip1Q922J3 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Clip1Q922J3 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Clip1Q922J3 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Clip1Q922J3 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Clip1Q922J3 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Clip1Q922J3 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Clip1Q922J3 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Clip1Q922J3 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Clip1Q922J3 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Clip1Q922J3 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Clip1Q922J3 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Clip1Q922J3 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Clip1Q922J3 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Clip1Q922J3 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Clip1Q922J3 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Clip1Q922J3 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Clip1Q922J3 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Clip1Q922J3 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Clip1Q922J3 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Clip1Q922J3 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Clip1Q922J3 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Clip1Q922J3 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Clip1Q922J3 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Clip1Q922J3 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Clip1Q922J3 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Clip1Q922J3 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Clip1Q922J3 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Clip1Q922J3 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Clip1Q922J3 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Clip1Q922J3 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Clip1Q922J3 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Clip1Q922J3 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Clip1Q922J3 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Clip1Q922J3 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Clip1Q922J3 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Clip1Q922J3 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Clip1Q922J3 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Clip1Q922J3 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Clip1Q922J3 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Clip1Q922J3 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Clip1Q922J3 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Clip1Q922J3 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Clip1Q922J3 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Clip1Q922J3 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Clip1Q922J3 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Clip1Q922J3 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Clip1Q922J3 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Clip1Q922J3 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Clip1Q922J3 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Clip1Q922J3 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Clip1Q922J3 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Clip1Q922J3 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Clip1Q922J3 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Clip1Q922J3 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Clip1Q922J3 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Clip1Q922J3 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Clip1Q922J3 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Clip1Q922J3 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Clip1Q922J3 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Clip1Q922J3 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Clip1Q922J3 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Clip1Q922J3 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Clip1Q922J3 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Clip1Q922J3 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Clip1Q922J3 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Clip1Q922J3 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Clip1Q922J3 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Clip1Q922J3 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Clip1Q922J3 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Clip1Q922J3 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Clip1Q922J3 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Clip1Q922J3 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Clip1Q922J3 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Clip1Q922J3 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Clip1Q922J3 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Clip1Q922J3 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Clip1Q922J3 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Clip1Q922J3 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Clip1Q922J3 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Clip1Q922J3 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Clip1Q922J3 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms