Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZQ5

Rpe65, Retinoid isomerohydrolase, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpe65Q91ZQ5 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpe65Q91ZQ5 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpe65Q91ZQ5 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpe65Q91ZQ5 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpe65Q91ZQ5 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpe65Q91ZQ5 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpe65Q91ZQ5 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpe65Q91ZQ5 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpe65Q91ZQ5 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpe65Q91ZQ5 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpe65Q91ZQ5 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpe65Q91ZQ5 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpe65Q91ZQ5 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpe65Q91ZQ5 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpe65Q91ZQ5 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpe65Q91ZQ5 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpe65Q91ZQ5 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpe65Q91ZQ5 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpe65Q91ZQ5 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpe65Q91ZQ5 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpe65Q91ZQ5 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpe65Q91ZQ5 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpe65Q91ZQ5 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpe65Q91ZQ5 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpe65Q91ZQ5 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpe65Q91ZQ5 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpe65Q91ZQ5 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpe65Q91ZQ5 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpe65Q91ZQ5 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpe65Q91ZQ5 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpe65Q91ZQ5 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpe65Q91ZQ5 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpe65Q91ZQ5 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpe65Q91ZQ5 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpe65Q91ZQ5 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpe65Q91ZQ5 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpe65Q91ZQ5 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpe65Q91ZQ5 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpe65Q91ZQ5 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpe65Q91ZQ5 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpe65Q91ZQ5 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpe65Q91ZQ5 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpe65Q91ZQ5 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpe65Q91ZQ5 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpe65Q91ZQ5 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpe65Q91ZQ5 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpe65Q91ZQ5 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Rpe65Q91ZQ5 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpe65Q91ZQ5 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpe65Q91ZQ5 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpe65Q91ZQ5 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpe65Q91ZQ5 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpe65Q91ZQ5 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpe65Q91ZQ5 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpe65Q91ZQ5 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpe65Q91ZQ5 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpe65Q91ZQ5 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Rpe65Q91ZQ5 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpe65Q91ZQ5 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpe65Q91ZQ5 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Rpe65Q91ZQ5 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Rpe65Q91ZQ5 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpe65Q91ZQ5 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Rpe65Q91ZQ5 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpe65Q91ZQ5 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Rpe65Q91ZQ5 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpe65Q91ZQ5 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpe65Q91ZQ5 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpe65Q91ZQ5 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpe65Q91ZQ5 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpe65Q91ZQ5 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpe65Q91ZQ5 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpe65Q91ZQ5 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpe65Q91ZQ5 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpe65Q91ZQ5 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpe65Q91ZQ5 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Rpe65Q91ZQ5 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpe65Q91ZQ5 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Rpe65Q91ZQ5 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpe65Q91ZQ5 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Rpe65Q91ZQ5 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Rpe65Q91ZQ5 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpe65Q91ZQ5 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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