Protein–RNA interactions for Protein: Q91YY4

Atpaf2, ATP synthase mitochondrial F1 complex assembly factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atpaf2Q91YY4 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atpaf2Q91YY4 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atpaf2Q91YY4 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atpaf2Q91YY4 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atpaf2Q91YY4 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atpaf2Q91YY4 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atpaf2Q91YY4 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atpaf2Q91YY4 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atpaf2Q91YY4 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atpaf2Q91YY4 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atpaf2Q91YY4 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atpaf2Q91YY4 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atpaf2Q91YY4 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atpaf2Q91YY4 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atpaf2Q91YY4 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atpaf2Q91YY4 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atpaf2Q91YY4 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atpaf2Q91YY4 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atpaf2Q91YY4 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atpaf2Q91YY4 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atpaf2Q91YY4 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atpaf2Q91YY4 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atpaf2Q91YY4 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atpaf2Q91YY4 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atpaf2Q91YY4 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atpaf2Q91YY4 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atpaf2Q91YY4 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Atpaf2Q91YY4 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atpaf2Q91YY4 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atpaf2Q91YY4 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atpaf2Q91YY4 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atpaf2Q91YY4 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atpaf2Q91YY4 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Atpaf2Q91YY4 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Atpaf2Q91YY4 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atpaf2Q91YY4 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atpaf2Q91YY4 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atpaf2Q91YY4 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atpaf2Q91YY4 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atpaf2Q91YY4 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atpaf2Q91YY4 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atpaf2Q91YY4 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atpaf2Q91YY4 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atpaf2Q91YY4 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atpaf2Q91YY4 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atpaf2Q91YY4 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atpaf2Q91YY4 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atpaf2Q91YY4 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atpaf2Q91YY4 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atpaf2Q91YY4 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atpaf2Q91YY4 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atpaf2Q91YY4 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atpaf2Q91YY4 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atpaf2Q91YY4 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atpaf2Q91YY4 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atpaf2Q91YY4 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atpaf2Q91YY4 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atpaf2Q91YY4 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atpaf2Q91YY4 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atpaf2Q91YY4 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Atpaf2Q91YY4 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atpaf2Q91YY4 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atpaf2Q91YY4 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atpaf2Q91YY4 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atpaf2Q91YY4 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atpaf2Q91YY4 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atpaf2Q91YY4 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Atpaf2Q91YY4 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atpaf2Q91YY4 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atpaf2Q91YY4 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atpaf2Q91YY4 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atpaf2Q91YY4 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atpaf2Q91YY4 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atpaf2Q91YY4 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atpaf2Q91YY4 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atpaf2Q91YY4 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atpaf2Q91YY4 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atpaf2Q91YY4 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atpaf2Q91YY4 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Atpaf2Q91YY4 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Atpaf2Q91YY4 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atpaf2Q91YY4 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atpaf2Q91YY4 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atpaf2Q91YY4 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atpaf2Q91YY4 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atpaf2Q91YY4 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atpaf2Q91YY4 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atpaf2Q91YY4 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atpaf2Q91YY4 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atpaf2Q91YY4 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Atpaf2Q91YY4 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Atpaf2Q91YY4 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atpaf2Q91YY4 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atpaf2Q91YY4 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Atpaf2Q91YY4 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Atpaf2Q91YY4 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Atpaf2Q91YY4 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atpaf2Q91YY4 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atpaf2Q91YY4 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atpaf2Q91YY4 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms