Protein–RNA interactions for Protein: Q91YK2

Rrp1b, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1bQ91YK2 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rrp1bQ91YK2 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rrp1bQ91YK2 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rrp1bQ91YK2 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rrp1bQ91YK2 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rrp1bQ91YK2 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rrp1bQ91YK2 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rrp1bQ91YK2 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rrp1bQ91YK2 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rrp1bQ91YK2 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rrp1bQ91YK2 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rrp1bQ91YK2 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rrp1bQ91YK2 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rrp1bQ91YK2 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rrp1bQ91YK2 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rrp1bQ91YK2 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rrp1bQ91YK2 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rrp1bQ91YK2 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rrp1bQ91YK2 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rrp1bQ91YK2 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rrp1bQ91YK2 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rrp1bQ91YK2 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rrp1bQ91YK2 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rrp1bQ91YK2 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rrp1bQ91YK2 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rrp1bQ91YK2 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rrp1bQ91YK2 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rrp1bQ91YK2 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rrp1bQ91YK2 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rrp1bQ91YK2 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rrp1bQ91YK2 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rrp1bQ91YK2 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rrp1bQ91YK2 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rrp1bQ91YK2 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rrp1bQ91YK2 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rrp1bQ91YK2 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rrp1bQ91YK2 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rrp1bQ91YK2 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rrp1bQ91YK2 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rrp1bQ91YK2 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rrp1bQ91YK2 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rrp1bQ91YK2 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rrp1bQ91YK2 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rrp1bQ91YK2 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rrp1bQ91YK2 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rrp1bQ91YK2 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rrp1bQ91YK2 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rrp1bQ91YK2 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rrp1bQ91YK2 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rrp1bQ91YK2 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rrp1bQ91YK2 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rrp1bQ91YK2 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rrp1bQ91YK2 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rrp1bQ91YK2 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rrp1bQ91YK2 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rrp1bQ91YK2 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rrp1bQ91YK2 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rrp1bQ91YK2 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rrp1bQ91YK2 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rrp1bQ91YK2 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rrp1bQ91YK2 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rrp1bQ91YK2 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rrp1bQ91YK2 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rrp1bQ91YK2 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rrp1bQ91YK2 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rrp1bQ91YK2 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rrp1bQ91YK2 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rrp1bQ91YK2 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rrp1bQ91YK2 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rrp1bQ91YK2 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rrp1bQ91YK2 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rrp1bQ91YK2 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rrp1bQ91YK2 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rrp1bQ91YK2 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rrp1bQ91YK2 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rrp1bQ91YK2 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rrp1bQ91YK2 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rrp1bQ91YK2 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rrp1bQ91YK2 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rrp1bQ91YK2 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rrp1bQ91YK2 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rrp1bQ91YK2 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rrp1bQ91YK2 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rrp1bQ91YK2 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rrp1bQ91YK2 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rrp1bQ91YK2 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rrp1bQ91YK2 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rrp1bQ91YK2 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rrp1bQ91YK2 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rrp1bQ91YK2 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rrp1bQ91YK2 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rrp1bQ91YK2 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rrp1bQ91YK2 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rrp1bQ91YK2 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rrp1bQ91YK2 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rrp1bQ91YK2 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rrp1bQ91YK2 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rrp1bQ91YK2 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rrp1bQ91YK2 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rrp1bQ91YK2 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms