Protein–RNA interactions for Protein: Q91XD2

Lims2, LIM and senescent cell antigen-like-containing domain protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lims2Q91XD2 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lims2Q91XD2 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lims2Q91XD2 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lims2Q91XD2 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lims2Q91XD2 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lims2Q91XD2 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lims2Q91XD2 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lims2Q91XD2 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lims2Q91XD2 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lims2Q91XD2 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lims2Q91XD2 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lims2Q91XD2 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lims2Q91XD2 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lims2Q91XD2 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Lims2Q91XD2 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Lims2Q91XD2 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Lims2Q91XD2 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lims2Q91XD2 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lims2Q91XD2 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lims2Q91XD2 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lims2Q91XD2 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lims2Q91XD2 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lims2Q91XD2 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lims2Q91XD2 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lims2Q91XD2 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lims2Q91XD2 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lims2Q91XD2 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lims2Q91XD2 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lims2Q91XD2 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lims2Q91XD2 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lims2Q91XD2 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lims2Q91XD2 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lims2Q91XD2 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lims2Q91XD2 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lims2Q91XD2 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lims2Q91XD2 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lims2Q91XD2 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lims2Q91XD2 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lims2Q91XD2 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lims2Q91XD2 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lims2Q91XD2 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lims2Q91XD2 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lims2Q91XD2 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lims2Q91XD2 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lims2Q91XD2 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lims2Q91XD2 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lims2Q91XD2 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lims2Q91XD2 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lims2Q91XD2 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lims2Q91XD2 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lims2Q91XD2 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lims2Q91XD2 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lims2Q91XD2 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lims2Q91XD2 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lims2Q91XD2 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lims2Q91XD2 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lims2Q91XD2 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lims2Q91XD2 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lims2Q91XD2 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lims2Q91XD2 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lims2Q91XD2 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lims2Q91XD2 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lims2Q91XD2 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lims2Q91XD2 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lims2Q91XD2 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lims2Q91XD2 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lims2Q91XD2 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lims2Q91XD2 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lims2Q91XD2 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lims2Q91XD2 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lims2Q91XD2 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lims2Q91XD2 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lims2Q91XD2 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lims2Q91XD2 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lims2Q91XD2 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lims2Q91XD2 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lims2Q91XD2 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lims2Q91XD2 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lims2Q91XD2 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lims2Q91XD2 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lims2Q91XD2 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lims2Q91XD2 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lims2Q91XD2 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lims2Q91XD2 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lims2Q91XD2 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lims2Q91XD2 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lims2Q91XD2 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lims2Q91XD2 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lims2Q91XD2 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lims2Q91XD2 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lims2Q91XD2 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lims2Q91XD2 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Lims2Q91XD2 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lims2Q91XD2 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lims2Q91XD2 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lims2Q91XD2 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lims2Q91XD2 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lims2Q91XD2 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lims2Q91XD2 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lims2Q91XD2 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms