Protein–RNA interactions for Protein: Q91W50

Csde1, Cold shock domain-containing protein E1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csde1Q91W50 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Csde1Q91W50 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Csde1Q91W50 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Csde1Q91W50 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Csde1Q91W50 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Csde1Q91W50 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Csde1Q91W50 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Csde1Q91W50 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Csde1Q91W50 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Csde1Q91W50 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Csde1Q91W50 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Csde1Q91W50 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Csde1Q91W50 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Csde1Q91W50 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Csde1Q91W50 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Csde1Q91W50 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Csde1Q91W50 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Csde1Q91W50 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Csde1Q91W50 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Csde1Q91W50 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Csde1Q91W50 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Csde1Q91W50 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Csde1Q91W50 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Csde1Q91W50 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Csde1Q91W50 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Csde1Q91W50 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Csde1Q91W50 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Csde1Q91W50 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Csde1Q91W50 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Csde1Q91W50 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Csde1Q91W50 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Csde1Q91W50 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Csde1Q91W50 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Csde1Q91W50 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Csde1Q91W50 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Csde1Q91W50 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Csde1Q91W50 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Csde1Q91W50 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Csde1Q91W50 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Csde1Q91W50 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Csde1Q91W50 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Csde1Q91W50 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Csde1Q91W50 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Csde1Q91W50 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Csde1Q91W50 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Csde1Q91W50 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Csde1Q91W50 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Csde1Q91W50 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Csde1Q91W50 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Csde1Q91W50 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Csde1Q91W50 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Csde1Q91W50 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Csde1Q91W50 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Csde1Q91W50 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Csde1Q91W50 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Csde1Q91W50 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Csde1Q91W50 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Csde1Q91W50 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Csde1Q91W50 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Csde1Q91W50 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Csde1Q91W50 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Csde1Q91W50 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Csde1Q91W50 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Csde1Q91W50 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Csde1Q91W50 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Csde1Q91W50 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Csde1Q91W50 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Csde1Q91W50 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Csde1Q91W50 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Csde1Q91W50 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Csde1Q91W50 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Csde1Q91W50 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Csde1Q91W50 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Csde1Q91W50 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Csde1Q91W50 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Csde1Q91W50 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Csde1Q91W50 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Csde1Q91W50 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Csde1Q91W50 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Csde1Q91W50 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Csde1Q91W50 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Csde1Q91W50 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Csde1Q91W50 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Csde1Q91W50 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Csde1Q91W50 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Csde1Q91W50 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Csde1Q91W50 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Csde1Q91W50 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Csde1Q91W50 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Csde1Q91W50 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Csde1Q91W50 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Csde1Q91W50 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Csde1Q91W50 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Csde1Q91W50 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Csde1Q91W50 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Csde1Q91W50 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Csde1Q91W50 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Csde1Q91W50 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Csde1Q91W50 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Csde1Q91W50 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.1 ms