Protein–RNA interactions for Protein: Q91VW9

Zkscan3, Zinc finger protein with KRAB and SCAN domains 3, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zkscan3Q91VW9 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zkscan3Q91VW9 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zkscan3Q91VW9 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zkscan3Q91VW9 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zkscan3Q91VW9 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zkscan3Q91VW9 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zkscan3Q91VW9 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zkscan3Q91VW9 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Zkscan3Q91VW9 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Zkscan3Q91VW9 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Zkscan3Q91VW9 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zkscan3Q91VW9 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zkscan3Q91VW9 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zkscan3Q91VW9 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zkscan3Q91VW9 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zkscan3Q91VW9 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zkscan3Q91VW9 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zkscan3Q91VW9 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zkscan3Q91VW9 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zkscan3Q91VW9 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zkscan3Q91VW9 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zkscan3Q91VW9 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zkscan3Q91VW9 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zkscan3Q91VW9 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zkscan3Q91VW9 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Zkscan3Q91VW9 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zkscan3Q91VW9 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zkscan3Q91VW9 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zkscan3Q91VW9 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zkscan3Q91VW9 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zkscan3Q91VW9 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zkscan3Q91VW9 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zkscan3Q91VW9 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zkscan3Q91VW9 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zkscan3Q91VW9 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zkscan3Q91VW9 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zkscan3Q91VW9 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zkscan3Q91VW9 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zkscan3Q91VW9 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zkscan3Q91VW9 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Zkscan3Q91VW9 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zkscan3Q91VW9 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zkscan3Q91VW9 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zkscan3Q91VW9 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zkscan3Q91VW9 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Zkscan3Q91VW9 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zkscan3Q91VW9 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zkscan3Q91VW9 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zkscan3Q91VW9 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zkscan3Q91VW9 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zkscan3Q91VW9 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zkscan3Q91VW9 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zkscan3Q91VW9 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zkscan3Q91VW9 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zkscan3Q91VW9 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zkscan3Q91VW9 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zkscan3Q91VW9 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zkscan3Q91VW9 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zkscan3Q91VW9 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zkscan3Q91VW9 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zkscan3Q91VW9 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zkscan3Q91VW9 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zkscan3Q91VW9 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zkscan3Q91VW9 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zkscan3Q91VW9 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zkscan3Q91VW9 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Zkscan3Q91VW9 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zkscan3Q91VW9 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zkscan3Q91VW9 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zkscan3Q91VW9 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zkscan3Q91VW9 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zkscan3Q91VW9 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zkscan3Q91VW9 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zkscan3Q91VW9 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zkscan3Q91VW9 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zkscan3Q91VW9 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zkscan3Q91VW9 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zkscan3Q91VW9 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zkscan3Q91VW9 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zkscan3Q91VW9 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zkscan3Q91VW9 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zkscan3Q91VW9 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Zkscan3Q91VW9 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zkscan3Q91VW9 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zkscan3Q91VW9 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zkscan3Q91VW9 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zkscan3Q91VW9 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zkscan3Q91VW9 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zkscan3Q91VW9 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zkscan3Q91VW9 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zkscan3Q91VW9 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zkscan3Q91VW9 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zkscan3Q91VW9 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zkscan3Q91VW9 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zkscan3Q91VW9 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zkscan3Q91VW9 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Zkscan3Q91VW9 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zkscan3Q91VW9 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zkscan3Q91VW9 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zkscan3Q91VW9 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms