Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEK0

Tmem30a, Cell cycle control protein 50A, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem30aQ8VEK0 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem30aQ8VEK0 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem30aQ8VEK0 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem30aQ8VEK0 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem30aQ8VEK0 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem30aQ8VEK0 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem30aQ8VEK0 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem30aQ8VEK0 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem30aQ8VEK0 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem30aQ8VEK0 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem30aQ8VEK0 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem30aQ8VEK0 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem30aQ8VEK0 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem30aQ8VEK0 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem30aQ8VEK0 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem30aQ8VEK0 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem30aQ8VEK0 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem30aQ8VEK0 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem30aQ8VEK0 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem30aQ8VEK0 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem30aQ8VEK0 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem30aQ8VEK0 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem30aQ8VEK0 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem30aQ8VEK0 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem30aQ8VEK0 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem30aQ8VEK0 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem30aQ8VEK0 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem30aQ8VEK0 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem30aQ8VEK0 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem30aQ8VEK0 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem30aQ8VEK0 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem30aQ8VEK0 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem30aQ8VEK0 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem30aQ8VEK0 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem30aQ8VEK0 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem30aQ8VEK0 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem30aQ8VEK0 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem30aQ8VEK0 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem30aQ8VEK0 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem30aQ8VEK0 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem30aQ8VEK0 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem30aQ8VEK0 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem30aQ8VEK0 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem30aQ8VEK0 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem30aQ8VEK0 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem30aQ8VEK0 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem30aQ8VEK0 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem30aQ8VEK0 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem30aQ8VEK0 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem30aQ8VEK0 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem30aQ8VEK0 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem30aQ8VEK0 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem30aQ8VEK0 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem30aQ8VEK0 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem30aQ8VEK0 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem30aQ8VEK0 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem30aQ8VEK0 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem30aQ8VEK0 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem30aQ8VEK0 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem30aQ8VEK0 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem30aQ8VEK0 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem30aQ8VEK0 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem30aQ8VEK0 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem30aQ8VEK0 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem30aQ8VEK0 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem30aQ8VEK0 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem30aQ8VEK0 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem30aQ8VEK0 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem30aQ8VEK0 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem30aQ8VEK0 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem30aQ8VEK0 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem30aQ8VEK0 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem30aQ8VEK0 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem30aQ8VEK0 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem30aQ8VEK0 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem30aQ8VEK0 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem30aQ8VEK0 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem30aQ8VEK0 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem30aQ8VEK0 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem30aQ8VEK0 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem30aQ8VEK0 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem30aQ8VEK0 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem30aQ8VEK0 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem30aQ8VEK0 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem30aQ8VEK0 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem30aQ8VEK0 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem30aQ8VEK0 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem30aQ8VEK0 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem30aQ8VEK0 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem30aQ8VEK0 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem30aQ8VEK0 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem30aQ8VEK0 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem30aQ8VEK0 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem30aQ8VEK0 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem30aQ8VEK0 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem30aQ8VEK0 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem30aQ8VEK0 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem30aQ8VEK0 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem30aQ8VEK0 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem30aQ8VEK0 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms