Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEE1

Lmcd1, LIM and cysteine-rich domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmcd1Q8VEE1 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Lmcd1Q8VEE1 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Lmcd1Q8VEE1 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Lmcd1Q8VEE1 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lmcd1Q8VEE1 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lmcd1Q8VEE1 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lmcd1Q8VEE1 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lmcd1Q8VEE1 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lmcd1Q8VEE1 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lmcd1Q8VEE1 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lmcd1Q8VEE1 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lmcd1Q8VEE1 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lmcd1Q8VEE1 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lmcd1Q8VEE1 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lmcd1Q8VEE1 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lmcd1Q8VEE1 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lmcd1Q8VEE1 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lmcd1Q8VEE1 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lmcd1Q8VEE1 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lmcd1Q8VEE1 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lmcd1Q8VEE1 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lmcd1Q8VEE1 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lmcd1Q8VEE1 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lmcd1Q8VEE1 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lmcd1Q8VEE1 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lmcd1Q8VEE1 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lmcd1Q8VEE1 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lmcd1Q8VEE1 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lmcd1Q8VEE1 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Lmcd1Q8VEE1 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Lmcd1Q8VEE1 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lmcd1Q8VEE1 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lmcd1Q8VEE1 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lmcd1Q8VEE1 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lmcd1Q8VEE1 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lmcd1Q8VEE1 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Lmcd1Q8VEE1 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Lmcd1Q8VEE1 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Lmcd1Q8VEE1 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lmcd1Q8VEE1 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lmcd1Q8VEE1 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lmcd1Q8VEE1 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lmcd1Q8VEE1 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lmcd1Q8VEE1 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lmcd1Q8VEE1 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lmcd1Q8VEE1 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lmcd1Q8VEE1 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lmcd1Q8VEE1 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lmcd1Q8VEE1 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lmcd1Q8VEE1 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lmcd1Q8VEE1 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lmcd1Q8VEE1 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lmcd1Q8VEE1 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Lmcd1Q8VEE1 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Lmcd1Q8VEE1 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Lmcd1Q8VEE1 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Lmcd1Q8VEE1 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lmcd1Q8VEE1 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lmcd1Q8VEE1 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lmcd1Q8VEE1 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lmcd1Q8VEE1 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lmcd1Q8VEE1 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Lmcd1Q8VEE1 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lmcd1Q8VEE1 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Lmcd1Q8VEE1 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lmcd1Q8VEE1 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lmcd1Q8VEE1 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lmcd1Q8VEE1 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lmcd1Q8VEE1 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lmcd1Q8VEE1 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lmcd1Q8VEE1 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lmcd1Q8VEE1 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lmcd1Q8VEE1 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Lmcd1Q8VEE1 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lmcd1Q8VEE1 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lmcd1Q8VEE1 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lmcd1Q8VEE1 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lmcd1Q8VEE1 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lmcd1Q8VEE1 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lmcd1Q8VEE1 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lmcd1Q8VEE1 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lmcd1Q8VEE1 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lmcd1Q8VEE1 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lmcd1Q8VEE1 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lmcd1Q8VEE1 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lmcd1Q8VEE1 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lmcd1Q8VEE1 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Lmcd1Q8VEE1 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lmcd1Q8VEE1 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Lmcd1Q8VEE1 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Lmcd1Q8VEE1 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lmcd1Q8VEE1 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lmcd1Q8VEE1 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lmcd1Q8VEE1 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lmcd1Q8VEE1 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lmcd1Q8VEE1 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lmcd1Q8VEE1 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lmcd1Q8VEE1 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lmcd1Q8VEE1 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lmcd1Q8VEE1 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.9 ms