Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE73

Cul7, Cullin-7, mousemouse

Predictions only

Length 1,689 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul7Q8VE73 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cul7Q8VE73 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cul7Q8VE73 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cul7Q8VE73 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cul7Q8VE73 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cul7Q8VE73 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cul7Q8VE73 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cul7Q8VE73 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Cul7Q8VE73 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cul7Q8VE73 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Cul7Q8VE73 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cul7Q8VE73 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cul7Q8VE73 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cul7Q8VE73 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cul7Q8VE73 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cul7Q8VE73 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cul7Q8VE73 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cul7Q8VE73 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cul7Q8VE73 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cul7Q8VE73 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cul7Q8VE73 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cul7Q8VE73 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cul7Q8VE73 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cul7Q8VE73 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Cul7Q8VE73 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cul7Q8VE73 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Cul7Q8VE73 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cul7Q8VE73 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cul7Q8VE73 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cul7Q8VE73 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cul7Q8VE73 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cul7Q8VE73 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cul7Q8VE73 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cul7Q8VE73 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cul7Q8VE73 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cul7Q8VE73 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Cul7Q8VE73 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cul7Q8VE73 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cul7Q8VE73 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cul7Q8VE73 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cul7Q8VE73 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cul7Q8VE73 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cul7Q8VE73 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cul7Q8VE73 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cul7Q8VE73 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cul7Q8VE73 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Cul7Q8VE73 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cul7Q8VE73 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cul7Q8VE73 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cul7Q8VE73 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cul7Q8VE73 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cul7Q8VE73 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cul7Q8VE73 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cul7Q8VE73 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Cul7Q8VE73 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cul7Q8VE73 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Cul7Q8VE73 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cul7Q8VE73 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cul7Q8VE73 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cul7Q8VE73 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cul7Q8VE73 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cul7Q8VE73 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cul7Q8VE73 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cul7Q8VE73 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cul7Q8VE73 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cul7Q8VE73 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Cul7Q8VE73 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cul7Q8VE73 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Cul7Q8VE73 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cul7Q8VE73 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cul7Q8VE73 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cul7Q8VE73 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cul7Q8VE73 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cul7Q8VE73 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cul7Q8VE73 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cul7Q8VE73 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cul7Q8VE73 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Cul7Q8VE73 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cul7Q8VE73 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cul7Q8VE73 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cul7Q8VE73 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cul7Q8VE73 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cul7Q8VE73 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Cul7Q8VE73 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Cul7Q8VE73 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cul7Q8VE73 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cul7Q8VE73 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cul7Q8VE73 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cul7Q8VE73 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cul7Q8VE73 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cul7Q8VE73 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cul7Q8VE73 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cul7Q8VE73 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cul7Q8VE73 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cul7Q8VE73 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cul7Q8VE73 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Cul7Q8VE73 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Cul7Q8VE73 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Cul7Q8VE73 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
Cul7Q8VE73 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms