Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDB9

Slc6a20a, Sodium- and chloride-dependent transporter XTRP3A, mousemouse

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Length 592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a20aQ8VDB9 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Slc6a20aQ8VDB9 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
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Slc6a20aQ8VDB9 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Slc6a20aQ8VDB9 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Slc6a20aQ8VDB9 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Slc6a20aQ8VDB9 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Slc6a20aQ8VDB9 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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