Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCE1

Dnajc28, DnaJ homolog subfamily C member 28, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc28Q8VCE1 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dnajc28Q8VCE1 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dnajc28Q8VCE1 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dnajc28Q8VCE1 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dnajc28Q8VCE1 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dnajc28Q8VCE1 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dnajc28Q8VCE1 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dnajc28Q8VCE1 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dnajc28Q8VCE1 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dnajc28Q8VCE1 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Dnajc28Q8VCE1 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dnajc28Q8VCE1 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dnajc28Q8VCE1 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dnajc28Q8VCE1 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Dnajc28Q8VCE1 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dnajc28Q8VCE1 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dnajc28Q8VCE1 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dnajc28Q8VCE1 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dnajc28Q8VCE1 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dnajc28Q8VCE1 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dnajc28Q8VCE1 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dnajc28Q8VCE1 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dnajc28Q8VCE1 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dnajc28Q8VCE1 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dnajc28Q8VCE1 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dnajc28Q8VCE1 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dnajc28Q8VCE1 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dnajc28Q8VCE1 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dnajc28Q8VCE1 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Dnajc28Q8VCE1 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Dnajc28Q8VCE1 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dnajc28Q8VCE1 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dnajc28Q8VCE1 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dnajc28Q8VCE1 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dnajc28Q8VCE1 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dnajc28Q8VCE1 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dnajc28Q8VCE1 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dnajc28Q8VCE1 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dnajc28Q8VCE1 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dnajc28Q8VCE1 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dnajc28Q8VCE1 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dnajc28Q8VCE1 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dnajc28Q8VCE1 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dnajc28Q8VCE1 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dnajc28Q8VCE1 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dnajc28Q8VCE1 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dnajc28Q8VCE1 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dnajc28Q8VCE1 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dnajc28Q8VCE1 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dnajc28Q8VCE1 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dnajc28Q8VCE1 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dnajc28Q8VCE1 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dnajc28Q8VCE1 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dnajc28Q8VCE1 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dnajc28Q8VCE1 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dnajc28Q8VCE1 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dnajc28Q8VCE1 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dnajc28Q8VCE1 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dnajc28Q8VCE1 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dnajc28Q8VCE1 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dnajc28Q8VCE1 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dnajc28Q8VCE1 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dnajc28Q8VCE1 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Dnajc28Q8VCE1 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dnajc28Q8VCE1 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dnajc28Q8VCE1 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dnajc28Q8VCE1 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dnajc28Q8VCE1 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dnajc28Q8VCE1 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dnajc28Q8VCE1 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dnajc28Q8VCE1 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dnajc28Q8VCE1 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dnajc28Q8VCE1 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dnajc28Q8VCE1 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnajc28Q8VCE1 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnajc28Q8VCE1 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnajc28Q8VCE1 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnajc28Q8VCE1 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnajc28Q8VCE1 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnajc28Q8VCE1 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnajc28Q8VCE1 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnajc28Q8VCE1 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnajc28Q8VCE1 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnajc28Q8VCE1 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnajc28Q8VCE1 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnajc28Q8VCE1 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnajc28Q8VCE1 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnajc28Q8VCE1 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnajc28Q8VCE1 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnajc28Q8VCE1 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnajc28Q8VCE1 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnajc28Q8VCE1 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnajc28Q8VCE1 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnajc28Q8VCE1 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnajc28Q8VCE1 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnajc28Q8VCE1 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnajc28Q8VCE1 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnajc28Q8VCE1 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnajc28Q8VCE1 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Dnajc28Q8VCE1 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.6 ms