Protein–RNA interactions for Protein: Q8VC66

Ssx2ip, Afadin- and alpha-actinin-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssx2ipQ8VC66 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssx2ipQ8VC66 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssx2ipQ8VC66 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssx2ipQ8VC66 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssx2ipQ8VC66 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssx2ipQ8VC66 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ssx2ipQ8VC66 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ssx2ipQ8VC66 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ssx2ipQ8VC66 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ssx2ipQ8VC66 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssx2ipQ8VC66 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssx2ipQ8VC66 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssx2ipQ8VC66 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssx2ipQ8VC66 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssx2ipQ8VC66 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssx2ipQ8VC66 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssx2ipQ8VC66 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssx2ipQ8VC66 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssx2ipQ8VC66 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssx2ipQ8VC66 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssx2ipQ8VC66 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssx2ipQ8VC66 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssx2ipQ8VC66 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssx2ipQ8VC66 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssx2ipQ8VC66 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssx2ipQ8VC66 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssx2ipQ8VC66 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssx2ipQ8VC66 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssx2ipQ8VC66 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssx2ipQ8VC66 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssx2ipQ8VC66 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssx2ipQ8VC66 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssx2ipQ8VC66 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssx2ipQ8VC66 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssx2ipQ8VC66 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssx2ipQ8VC66 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssx2ipQ8VC66 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssx2ipQ8VC66 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssx2ipQ8VC66 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssx2ipQ8VC66 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssx2ipQ8VC66 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssx2ipQ8VC66 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssx2ipQ8VC66 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssx2ipQ8VC66 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssx2ipQ8VC66 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssx2ipQ8VC66 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssx2ipQ8VC66 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssx2ipQ8VC66 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssx2ipQ8VC66 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssx2ipQ8VC66 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssx2ipQ8VC66 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssx2ipQ8VC66 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssx2ipQ8VC66 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssx2ipQ8VC66 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssx2ipQ8VC66 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssx2ipQ8VC66 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssx2ipQ8VC66 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssx2ipQ8VC66 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssx2ipQ8VC66 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssx2ipQ8VC66 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssx2ipQ8VC66 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssx2ipQ8VC66 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssx2ipQ8VC66 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssx2ipQ8VC66 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssx2ipQ8VC66 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssx2ipQ8VC66 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssx2ipQ8VC66 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssx2ipQ8VC66 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssx2ipQ8VC66 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssx2ipQ8VC66 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssx2ipQ8VC66 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssx2ipQ8VC66 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssx2ipQ8VC66 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssx2ipQ8VC66 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssx2ipQ8VC66 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssx2ipQ8VC66 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssx2ipQ8VC66 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssx2ipQ8VC66 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssx2ipQ8VC66 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssx2ipQ8VC66 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssx2ipQ8VC66 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssx2ipQ8VC66 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssx2ipQ8VC66 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssx2ipQ8VC66 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssx2ipQ8VC66 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssx2ipQ8VC66 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssx2ipQ8VC66 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssx2ipQ8VC66 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssx2ipQ8VC66 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssx2ipQ8VC66 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssx2ipQ8VC66 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssx2ipQ8VC66 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssx2ipQ8VC66 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssx2ipQ8VC66 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssx2ipQ8VC66 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssx2ipQ8VC66 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssx2ipQ8VC66 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssx2ipQ8VC66 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssx2ipQ8VC66 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssx2ipQ8VC66 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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