Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3Q6

Ccdc58, Coiled-coil domain-containing protein 58, mousemouse

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Length 144 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc58Q8R3Q6 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccdc58Q8R3Q6 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc58Q8R3Q6 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc58Q8R3Q6 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc58Q8R3Q6 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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