Protein–RNA interactions for Protein: Q8R368

Dnaaf4, Dynein assembly factor 4, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnaaf4Q8R368 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dnaaf4Q8R368 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dnaaf4Q8R368 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dnaaf4Q8R368 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dnaaf4Q8R368 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dnaaf4Q8R368 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dnaaf4Q8R368 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dnaaf4Q8R368 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dnaaf4Q8R368 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dnaaf4Q8R368 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dnaaf4Q8R368 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dnaaf4Q8R368 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dnaaf4Q8R368 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dnaaf4Q8R368 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dnaaf4Q8R368 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dnaaf4Q8R368 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dnaaf4Q8R368 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dnaaf4Q8R368 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dnaaf4Q8R368 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dnaaf4Q8R368 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Dnaaf4Q8R368 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Dnaaf4Q8R368 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Dnaaf4Q8R368 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dnaaf4Q8R368 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dnaaf4Q8R368 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dnaaf4Q8R368 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dnaaf4Q8R368 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dnaaf4Q8R368 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dnaaf4Q8R368 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dnaaf4Q8R368 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dnaaf4Q8R368 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dnaaf4Q8R368 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dnaaf4Q8R368 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dnaaf4Q8R368 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dnaaf4Q8R368 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dnaaf4Q8R368 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dnaaf4Q8R368 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dnaaf4Q8R368 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dnaaf4Q8R368 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dnaaf4Q8R368 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dnaaf4Q8R368 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dnaaf4Q8R368 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dnaaf4Q8R368 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dnaaf4Q8R368 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dnaaf4Q8R368 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dnaaf4Q8R368 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dnaaf4Q8R368 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dnaaf4Q8R368 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dnaaf4Q8R368 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Dnaaf4Q8R368 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dnaaf4Q8R368 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dnaaf4Q8R368 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dnaaf4Q8R368 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dnaaf4Q8R368 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Dnaaf4Q8R368 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dnaaf4Q8R368 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dnaaf4Q8R368 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dnaaf4Q8R368 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dnaaf4Q8R368 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Dnaaf4Q8R368 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Dnaaf4Q8R368 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dnaaf4Q8R368 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dnaaf4Q8R368 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dnaaf4Q8R368 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dnaaf4Q8R368 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Dnaaf4Q8R368 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dnaaf4Q8R368 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dnaaf4Q8R368 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dnaaf4Q8R368 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dnaaf4Q8R368 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dnaaf4Q8R368 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dnaaf4Q8R368 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dnaaf4Q8R368 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dnaaf4Q8R368 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dnaaf4Q8R368 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dnaaf4Q8R368 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dnaaf4Q8R368 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dnaaf4Q8R368 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Dnaaf4Q8R368 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dnaaf4Q8R368 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dnaaf4Q8R368 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dnaaf4Q8R368 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dnaaf4Q8R368 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dnaaf4Q8R368 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dnaaf4Q8R368 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Dnaaf4Q8R368 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dnaaf4Q8R368 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Dnaaf4Q8R368 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dnaaf4Q8R368 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dnaaf4Q8R368 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dnaaf4Q8R368 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dnaaf4Q8R368 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dnaaf4Q8R368 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dnaaf4Q8R368 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dnaaf4Q8R368 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dnaaf4Q8R368 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dnaaf4Q8R368 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dnaaf4Q8R368 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dnaaf4Q8R368 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dnaaf4Q8R368 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms