Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2Q0

Trim29, Tripartite motif-containing protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim29Q8R2Q0 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trim29Q8R2Q0 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trim29Q8R2Q0 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trim29Q8R2Q0 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trim29Q8R2Q0 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trim29Q8R2Q0 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trim29Q8R2Q0 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trim29Q8R2Q0 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trim29Q8R2Q0 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trim29Q8R2Q0 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trim29Q8R2Q0 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trim29Q8R2Q0 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trim29Q8R2Q0 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Trim29Q8R2Q0 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim29Q8R2Q0 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim29Q8R2Q0 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim29Q8R2Q0 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim29Q8R2Q0 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim29Q8R2Q0 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim29Q8R2Q0 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim29Q8R2Q0 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim29Q8R2Q0 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim29Q8R2Q0 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim29Q8R2Q0 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim29Q8R2Q0 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim29Q8R2Q0 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim29Q8R2Q0 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim29Q8R2Q0 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim29Q8R2Q0 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim29Q8R2Q0 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim29Q8R2Q0 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim29Q8R2Q0 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim29Q8R2Q0 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim29Q8R2Q0 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim29Q8R2Q0 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim29Q8R2Q0 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim29Q8R2Q0 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim29Q8R2Q0 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim29Q8R2Q0 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim29Q8R2Q0 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim29Q8R2Q0 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim29Q8R2Q0 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim29Q8R2Q0 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim29Q8R2Q0 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim29Q8R2Q0 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim29Q8R2Q0 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim29Q8R2Q0 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim29Q8R2Q0 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim29Q8R2Q0 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim29Q8R2Q0 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim29Q8R2Q0 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim29Q8R2Q0 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim29Q8R2Q0 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim29Q8R2Q0 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim29Q8R2Q0 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim29Q8R2Q0 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim29Q8R2Q0 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim29Q8R2Q0 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim29Q8R2Q0 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim29Q8R2Q0 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim29Q8R2Q0 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim29Q8R2Q0 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim29Q8R2Q0 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim29Q8R2Q0 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim29Q8R2Q0 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim29Q8R2Q0 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim29Q8R2Q0 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim29Q8R2Q0 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim29Q8R2Q0 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim29Q8R2Q0 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim29Q8R2Q0 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim29Q8R2Q0 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim29Q8R2Q0 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim29Q8R2Q0 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim29Q8R2Q0 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim29Q8R2Q0 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim29Q8R2Q0 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim29Q8R2Q0 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim29Q8R2Q0 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim29Q8R2Q0 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim29Q8R2Q0 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim29Q8R2Q0 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim29Q8R2Q0 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim29Q8R2Q0 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim29Q8R2Q0 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim29Q8R2Q0 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim29Q8R2Q0 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim29Q8R2Q0 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim29Q8R2Q0 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim29Q8R2Q0 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim29Q8R2Q0 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim29Q8R2Q0 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim29Q8R2Q0 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim29Q8R2Q0 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim29Q8R2Q0 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim29Q8R2Q0 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim29Q8R2Q0 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim29Q8R2Q0 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim29Q8R2Q0 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim29Q8R2Q0 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.6 ms