Protein–RNA interactions for Protein: Q8K409

Polb, DNA polymerase beta, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolbQ8K409 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PolbQ8K409 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PolbQ8K409 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PolbQ8K409 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PolbQ8K409 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PolbQ8K409 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PolbQ8K409 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PolbQ8K409 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PolbQ8K409 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PolbQ8K409 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PolbQ8K409 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PolbQ8K409 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PolbQ8K409 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PolbQ8K409 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PolbQ8K409 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PolbQ8K409 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
PolbQ8K409 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PolbQ8K409 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PolbQ8K409 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PolbQ8K409 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PolbQ8K409 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PolbQ8K409 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PolbQ8K409 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PolbQ8K409 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PolbQ8K409 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PolbQ8K409 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PolbQ8K409 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PolbQ8K409 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PolbQ8K409 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PolbQ8K409 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PolbQ8K409 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PolbQ8K409 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
PolbQ8K409 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
PolbQ8K409 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PolbQ8K409 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PolbQ8K409 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PolbQ8K409 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PolbQ8K409 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PolbQ8K409 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PolbQ8K409 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PolbQ8K409 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PolbQ8K409 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PolbQ8K409 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PolbQ8K409 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PolbQ8K409 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PolbQ8K409 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PolbQ8K409 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PolbQ8K409 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PolbQ8K409 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PolbQ8K409 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PolbQ8K409 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PolbQ8K409 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PolbQ8K409 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PolbQ8K409 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PolbQ8K409 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PolbQ8K409 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PolbQ8K409 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PolbQ8K409 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PolbQ8K409 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PolbQ8K409 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PolbQ8K409 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PolbQ8K409 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PolbQ8K409 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PolbQ8K409 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PolbQ8K409 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PolbQ8K409 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PolbQ8K409 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PolbQ8K409 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PolbQ8K409 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PolbQ8K409 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PolbQ8K409 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PolbQ8K409 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PolbQ8K409 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PolbQ8K409 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PolbQ8K409 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PolbQ8K409 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PolbQ8K409 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PolbQ8K409 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PolbQ8K409 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PolbQ8K409 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PolbQ8K409 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PolbQ8K409 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PolbQ8K409 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PolbQ8K409 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PolbQ8K409 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PolbQ8K409 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PolbQ8K409 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PolbQ8K409 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
PolbQ8K409 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PolbQ8K409 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PolbQ8K409 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PolbQ8K409 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PolbQ8K409 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PolbQ8K409 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PolbQ8K409 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PolbQ8K409 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PolbQ8K409 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PolbQ8K409 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PolbQ8K409 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PolbQ8K409 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms