Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3I4

Myrip, Rab effector MyRIP, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MyripQ8K3I4 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MyripQ8K3I4 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MyripQ8K3I4 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MyripQ8K3I4 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MyripQ8K3I4 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MyripQ8K3I4 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MyripQ8K3I4 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MyripQ8K3I4 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MyripQ8K3I4 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MyripQ8K3I4 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MyripQ8K3I4 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MyripQ8K3I4 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MyripQ8K3I4 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MyripQ8K3I4 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MyripQ8K3I4 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MyripQ8K3I4 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MyripQ8K3I4 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MyripQ8K3I4 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MyripQ8K3I4 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MyripQ8K3I4 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MyripQ8K3I4 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MyripQ8K3I4 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MyripQ8K3I4 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MyripQ8K3I4 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MyripQ8K3I4 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MyripQ8K3I4 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MyripQ8K3I4 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MyripQ8K3I4 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MyripQ8K3I4 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MyripQ8K3I4 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MyripQ8K3I4 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MyripQ8K3I4 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MyripQ8K3I4 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MyripQ8K3I4 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MyripQ8K3I4 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MyripQ8K3I4 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MyripQ8K3I4 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MyripQ8K3I4 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MyripQ8K3I4 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MyripQ8K3I4 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MyripQ8K3I4 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MyripQ8K3I4 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MyripQ8K3I4 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MyripQ8K3I4 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MyripQ8K3I4 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MyripQ8K3I4 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
MyripQ8K3I4 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
MyripQ8K3I4 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MyripQ8K3I4 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
MyripQ8K3I4 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
MyripQ8K3I4 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MyripQ8K3I4 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MyripQ8K3I4 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
MyripQ8K3I4 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
MyripQ8K3I4 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
MyripQ8K3I4 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
MyripQ8K3I4 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
MyripQ8K3I4 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
MyripQ8K3I4 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
MyripQ8K3I4 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
MyripQ8K3I4 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MyripQ8K3I4 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MyripQ8K3I4 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MyripQ8K3I4 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MyripQ8K3I4 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MyripQ8K3I4 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MyripQ8K3I4 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MyripQ8K3I4 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MyripQ8K3I4 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MyripQ8K3I4 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MyripQ8K3I4 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
MyripQ8K3I4 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MyripQ8K3I4 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MyripQ8K3I4 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MyripQ8K3I4 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MyripQ8K3I4 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MyripQ8K3I4 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MyripQ8K3I4 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MyripQ8K3I4 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MyripQ8K3I4 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MyripQ8K3I4 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
MyripQ8K3I4 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MyripQ8K3I4 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MyripQ8K3I4 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MyripQ8K3I4 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
MyripQ8K3I4 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
MyripQ8K3I4 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC17■□□□□ 0.31
MyripQ8K3I4 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MyripQ8K3I4 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MyripQ8K3I4 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MyripQ8K3I4 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
MyripQ8K3I4 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MyripQ8K3I4 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MyripQ8K3I4 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MyripQ8K3I4 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MyripQ8K3I4 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
MyripQ8K3I4 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MyripQ8K3I4 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MyripQ8K3I4 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
MyripQ8K3I4 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms