Protein–RNA interactions for Protein: Q8K389

Cdk5rap2, CDK5 regulatory subunit-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5rap2Q8K389 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cdk5rap2Q8K389 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cdk5rap2Q8K389 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cdk5rap2Q8K389 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cdk5rap2Q8K389 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Cdk5rap2Q8K389 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cdk5rap2Q8K389 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cdk5rap2Q8K389 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cdk5rap2Q8K389 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cdk5rap2Q8K389 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cdk5rap2Q8K389 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cdk5rap2Q8K389 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cdk5rap2Q8K389 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cdk5rap2Q8K389 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cdk5rap2Q8K389 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cdk5rap2Q8K389 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Cdk5rap2Q8K389 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Cdk5rap2Q8K389 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cdk5rap2Q8K389 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cdk5rap2Q8K389 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cdk5rap2Q8K389 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cdk5rap2Q8K389 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cdk5rap2Q8K389 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cdk5rap2Q8K389 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cdk5rap2Q8K389 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cdk5rap2Q8K389 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cdk5rap2Q8K389 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Cdk5rap2Q8K389 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cdk5rap2Q8K389 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cdk5rap2Q8K389 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cdk5rap2Q8K389 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cdk5rap2Q8K389 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cdk5rap2Q8K389 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cdk5rap2Q8K389 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cdk5rap2Q8K389 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cdk5rap2Q8K389 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cdk5rap2Q8K389 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cdk5rap2Q8K389 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Cdk5rap2Q8K389 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cdk5rap2Q8K389 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cdk5rap2Q8K389 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cdk5rap2Q8K389 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cdk5rap2Q8K389 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Cdk5rap2Q8K389 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cdk5rap2Q8K389 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cdk5rap2Q8K389 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cdk5rap2Q8K389 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cdk5rap2Q8K389 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cdk5rap2Q8K389 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cdk5rap2Q8K389 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cdk5rap2Q8K389 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cdk5rap2Q8K389 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cdk5rap2Q8K389 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cdk5rap2Q8K389 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cdk5rap2Q8K389 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cdk5rap2Q8K389 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cdk5rap2Q8K389 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Cdk5rap2Q8K389 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Cdk5rap2Q8K389 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cdk5rap2Q8K389 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cdk5rap2Q8K389 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cdk5rap2Q8K389 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cdk5rap2Q8K389 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cdk5rap2Q8K389 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cdk5rap2Q8K389 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cdk5rap2Q8K389 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cdk5rap2Q8K389 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cdk5rap2Q8K389 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cdk5rap2Q8K389 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cdk5rap2Q8K389 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cdk5rap2Q8K389 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cdk5rap2Q8K389 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cdk5rap2Q8K389 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cdk5rap2Q8K389 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cdk5rap2Q8K389 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cdk5rap2Q8K389 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cdk5rap2Q8K389 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cdk5rap2Q8K389 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cdk5rap2Q8K389 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cdk5rap2Q8K389 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cdk5rap2Q8K389 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cdk5rap2Q8K389 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cdk5rap2Q8K389 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cdk5rap2Q8K389 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cdk5rap2Q8K389 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cdk5rap2Q8K389 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cdk5rap2Q8K389 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdk5rap2Q8K389 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdk5rap2Q8K389 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdk5rap2Q8K389 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdk5rap2Q8K389 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdk5rap2Q8K389 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdk5rap2Q8K389 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdk5rap2Q8K389 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdk5rap2Q8K389 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdk5rap2Q8K389 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdk5rap2Q8K389 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdk5rap2Q8K389 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdk5rap2Q8K389 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdk5rap2Q8K389 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms