Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2I9

Fbxo18, F-box DNA helicase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo18Q8K2I9 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fbxo18Q8K2I9 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fbxo18Q8K2I9 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fbxo18Q8K2I9 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fbxo18Q8K2I9 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fbxo18Q8K2I9 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fbxo18Q8K2I9 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fbxo18Q8K2I9 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fbxo18Q8K2I9 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fbxo18Q8K2I9 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fbxo18Q8K2I9 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fbxo18Q8K2I9 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fbxo18Q8K2I9 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fbxo18Q8K2I9 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Fbxo18Q8K2I9 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fbxo18Q8K2I9 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fbxo18Q8K2I9 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fbxo18Q8K2I9 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fbxo18Q8K2I9 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fbxo18Q8K2I9 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Fbxo18Q8K2I9 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fbxo18Q8K2I9 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fbxo18Q8K2I9 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fbxo18Q8K2I9 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fbxo18Q8K2I9 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fbxo18Q8K2I9 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fbxo18Q8K2I9 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fbxo18Q8K2I9 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fbxo18Q8K2I9 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fbxo18Q8K2I9 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fbxo18Q8K2I9 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Fbxo18Q8K2I9 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fbxo18Q8K2I9 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fbxo18Q8K2I9 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fbxo18Q8K2I9 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fbxo18Q8K2I9 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fbxo18Q8K2I9 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fbxo18Q8K2I9 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fbxo18Q8K2I9 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fbxo18Q8K2I9 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fbxo18Q8K2I9 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fbxo18Q8K2I9 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fbxo18Q8K2I9 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fbxo18Q8K2I9 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fbxo18Q8K2I9 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Fbxo18Q8K2I9 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Fbxo18Q8K2I9 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fbxo18Q8K2I9 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fbxo18Q8K2I9 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fbxo18Q8K2I9 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fbxo18Q8K2I9 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fbxo18Q8K2I9 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fbxo18Q8K2I9 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fbxo18Q8K2I9 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Fbxo18Q8K2I9 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fbxo18Q8K2I9 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fbxo18Q8K2I9 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fbxo18Q8K2I9 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fbxo18Q8K2I9 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Fbxo18Q8K2I9 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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Fbxo18Q8K2I9 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fbxo18Q8K2I9 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fbxo18Q8K2I9 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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Fbxo18Q8K2I9 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Fbxo18Q8K2I9 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fbxo18Q8K2I9 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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Fbxo18Q8K2I9 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fbxo18Q8K2I9 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fbxo18Q8K2I9 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fbxo18Q8K2I9 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fbxo18Q8K2I9 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fbxo18Q8K2I9 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fbxo18Q8K2I9 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fbxo18Q8K2I9 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fbxo18Q8K2I9 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fbxo18Q8K2I9 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fbxo18Q8K2I9 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fbxo18Q8K2I9 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fbxo18Q8K2I9 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fbxo18Q8K2I9 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fbxo18Q8K2I9 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fbxo18Q8K2I9 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fbxo18Q8K2I9 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fbxo18Q8K2I9 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Fbxo18Q8K2I9 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fbxo18Q8K2I9 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fbxo18Q8K2I9 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Fbxo18Q8K2I9 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fbxo18Q8K2I9 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fbxo18Q8K2I9 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fbxo18Q8K2I9 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fbxo18Q8K2I9 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fbxo18Q8K2I9 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fbxo18Q8K2I9 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fbxo18Q8K2I9 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Fbxo18Q8K2I9 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Fbxo18Q8K2I9 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms