Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F3

Depp1, Protein DEPP1, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Depp1Q8K2F3 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Depp1Q8K2F3 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Depp1Q8K2F3 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Depp1Q8K2F3 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Depp1Q8K2F3 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Depp1Q8K2F3 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Depp1Q8K2F3 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Depp1Q8K2F3 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Depp1Q8K2F3 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Depp1Q8K2F3 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Depp1Q8K2F3 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Depp1Q8K2F3 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Depp1Q8K2F3 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Depp1Q8K2F3 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Depp1Q8K2F3 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Depp1Q8K2F3 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Depp1Q8K2F3 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Depp1Q8K2F3 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Depp1Q8K2F3 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Depp1Q8K2F3 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Depp1Q8K2F3 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Depp1Q8K2F3 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Depp1Q8K2F3 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Depp1Q8K2F3 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Depp1Q8K2F3 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Depp1Q8K2F3 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Depp1Q8K2F3 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Depp1Q8K2F3 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Depp1Q8K2F3 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Depp1Q8K2F3 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Depp1Q8K2F3 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Depp1Q8K2F3 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Depp1Q8K2F3 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Depp1Q8K2F3 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Depp1Q8K2F3 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Depp1Q8K2F3 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Depp1Q8K2F3 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Depp1Q8K2F3 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Depp1Q8K2F3 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Depp1Q8K2F3 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Depp1Q8K2F3 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Depp1Q8K2F3 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Depp1Q8K2F3 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Depp1Q8K2F3 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Depp1Q8K2F3 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Depp1Q8K2F3 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Depp1Q8K2F3 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Depp1Q8K2F3 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Depp1Q8K2F3 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Depp1Q8K2F3 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Depp1Q8K2F3 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Depp1Q8K2F3 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Depp1Q8K2F3 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Depp1Q8K2F3 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Depp1Q8K2F3 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Depp1Q8K2F3 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Depp1Q8K2F3 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Depp1Q8K2F3 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Depp1Q8K2F3 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Depp1Q8K2F3 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Depp1Q8K2F3 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Depp1Q8K2F3 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Depp1Q8K2F3 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Depp1Q8K2F3 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Depp1Q8K2F3 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Depp1Q8K2F3 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Depp1Q8K2F3 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Depp1Q8K2F3 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Depp1Q8K2F3 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Depp1Q8K2F3 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Depp1Q8K2F3 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Depp1Q8K2F3 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Depp1Q8K2F3 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Depp1Q8K2F3 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Depp1Q8K2F3 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Depp1Q8K2F3 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Depp1Q8K2F3 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Depp1Q8K2F3 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Depp1Q8K2F3 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Depp1Q8K2F3 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Depp1Q8K2F3 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Depp1Q8K2F3 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Depp1Q8K2F3 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Depp1Q8K2F3 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Depp1Q8K2F3 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Depp1Q8K2F3 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Depp1Q8K2F3 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Depp1Q8K2F3 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Depp1Q8K2F3 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Depp1Q8K2F3 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Depp1Q8K2F3 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Depp1Q8K2F3 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Depp1Q8K2F3 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Depp1Q8K2F3 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Depp1Q8K2F3 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Depp1Q8K2F3 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Depp1Q8K2F3 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Depp1Q8K2F3 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Depp1Q8K2F3 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Depp1Q8K2F3 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms