Protein–RNA interactions for Protein: Q8K193

Cldn34c1, Claudin 34C1, mousemouse

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Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c1Q8K193 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn34c1Q8K193 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn34c1Q8K193 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn34c1Q8K193 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn34c1Q8K193 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn34c1Q8K193 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn34c1Q8K193 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn34c1Q8K193 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn34c1Q8K193 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn34c1Q8K193 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn34c1Q8K193 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn34c1Q8K193 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn34c1Q8K193 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn34c1Q8K193 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn34c1Q8K193 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn34c1Q8K193 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn34c1Q8K193 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn34c1Q8K193 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn34c1Q8K193 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn34c1Q8K193 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn34c1Q8K193 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn34c1Q8K193 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn34c1Q8K193 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn34c1Q8K193 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn34c1Q8K193 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn34c1Q8K193 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn34c1Q8K193 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn34c1Q8K193 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn34c1Q8K193 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn34c1Q8K193 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn34c1Q8K193 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn34c1Q8K193 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn34c1Q8K193 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn34c1Q8K193 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn34c1Q8K193 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn34c1Q8K193 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn34c1Q8K193 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn34c1Q8K193 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn34c1Q8K193 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn34c1Q8K193 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn34c1Q8K193 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn34c1Q8K193 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn34c1Q8K193 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn34c1Q8K193 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn34c1Q8K193 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn34c1Q8K193 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn34c1Q8K193 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn34c1Q8K193 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn34c1Q8K193 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn34c1Q8K193 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn34c1Q8K193 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn34c1Q8K193 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn34c1Q8K193 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn34c1Q8K193 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn34c1Q8K193 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn34c1Q8K193 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn34c1Q8K193 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn34c1Q8K193 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn34c1Q8K193 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn34c1Q8K193 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn34c1Q8K193 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn34c1Q8K193 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn34c1Q8K193 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn34c1Q8K193 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn34c1Q8K193 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn34c1Q8K193 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn34c1Q8K193 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn34c1Q8K193 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn34c1Q8K193 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn34c1Q8K193 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn34c1Q8K193 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn34c1Q8K193 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn34c1Q8K193 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn34c1Q8K193 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn34c1Q8K193 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn34c1Q8K193 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn34c1Q8K193 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn34c1Q8K193 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn34c1Q8K193 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn34c1Q8K193 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn34c1Q8K193 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn34c1Q8K193 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn34c1Q8K193 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn34c1Q8K193 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn34c1Q8K193 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn34c1Q8K193 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn34c1Q8K193 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn34c1Q8K193 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn34c1Q8K193 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn34c1Q8K193 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn34c1Q8K193 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn34c1Q8K193 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn34c1Q8K193 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn34c1Q8K193 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn34c1Q8K193 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn34c1Q8K193 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn34c1Q8K193 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn34c1Q8K193 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn34c1Q8K193 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn34c1Q8K193 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
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