Protein–RNA interactions for Protein: Q8K045

Pkn3, Serine/threonine-protein kinase N3, mousemouse

Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn3Q8K045 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pkn3Q8K045 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pkn3Q8K045 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pkn3Q8K045 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pkn3Q8K045 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pkn3Q8K045 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pkn3Q8K045 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pkn3Q8K045 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Pkn3Q8K045 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pkn3Q8K045 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pkn3Q8K045 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pkn3Q8K045 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pkn3Q8K045 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pkn3Q8K045 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pkn3Q8K045 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pkn3Q8K045 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pkn3Q8K045 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pkn3Q8K045 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pkn3Q8K045 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Pkn3Q8K045 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Pkn3Q8K045 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pkn3Q8K045 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pkn3Q8K045 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pkn3Q8K045 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pkn3Q8K045 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pkn3Q8K045 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pkn3Q8K045 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pkn3Q8K045 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pkn3Q8K045 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pkn3Q8K045 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pkn3Q8K045 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pkn3Q8K045 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pkn3Q8K045 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pkn3Q8K045 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pkn3Q8K045 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pkn3Q8K045 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pkn3Q8K045 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pkn3Q8K045 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pkn3Q8K045 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pkn3Q8K045 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pkn3Q8K045 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pkn3Q8K045 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pkn3Q8K045 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pkn3Q8K045 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Pkn3Q8K045 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Pkn3Q8K045 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pkn3Q8K045 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Pkn3Q8K045 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Pkn3Q8K045 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pkn3Q8K045 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Pkn3Q8K045 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pkn3Q8K045 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Pkn3Q8K045 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pkn3Q8K045 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pkn3Q8K045 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pkn3Q8K045 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pkn3Q8K045 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pkn3Q8K045 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pkn3Q8K045 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pkn3Q8K045 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pkn3Q8K045 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pkn3Q8K045 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pkn3Q8K045 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pkn3Q8K045 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pkn3Q8K045 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pkn3Q8K045 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pkn3Q8K045 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pkn3Q8K045 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pkn3Q8K045 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pkn3Q8K045 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pkn3Q8K045 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pkn3Q8K045 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pkn3Q8K045 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pkn3Q8K045 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pkn3Q8K045 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pkn3Q8K045 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pkn3Q8K045 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pkn3Q8K045 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pkn3Q8K045 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pkn3Q8K045 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pkn3Q8K045 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pkn3Q8K045 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pkn3Q8K045 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pkn3Q8K045 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pkn3Q8K045 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pkn3Q8K045 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pkn3Q8K045 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pkn3Q8K045 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pkn3Q8K045 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pkn3Q8K045 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pkn3Q8K045 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pkn3Q8K045 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pkn3Q8K045 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pkn3Q8K045 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pkn3Q8K045 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pkn3Q8K045 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pkn3Q8K045 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pkn3Q8K045 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pkn3Q8K045 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pkn3Q8K045 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms